玛瑙红樱桃不同发育时期胚败育果实转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 宋莎
作者: 宋莎;江旭升;金吉林;张绿萍;张敏
作者机构:
关键词: 玛瑙红樱桃;胚败育;转录组测序;生育期;差异表达基因
期刊名称: 贵州农业科学
ISSN: 1001-3601
年卷期: 2025 年 53 卷 001 期
页码: 76-82
收录情况: 北大核心
摘要: 【目的】探明玛瑙红樱桃胚败育果实发育过程中相关基因的表达差异,为筛选胚败育相关基因提供理论依据。【方法】采用Illumina高通量测序技术,对不同发育时期(膨大期、转色期、成熟期)的玛瑙红樱桃胚败育果实样品进行转录组测序及相关分析。【结果】所有玛瑙红樱桃样品的高质量序列均在98%以上,映射序列均在85%以上,Q30均大于94%;共筛选出差异表达基因6 316个,其中,不同比较组共有差异表达基因1 207个;注释到GO的差异表达基因参与分子功能、细胞组分、生物过程等,参与生物过程最多;注释到KEGG通路的差异表达基因分别参与环境信息处理、生物体系统、遗传信息处理、细胞过程和新陈代谢5大通路的18个分支,注释到碳水化合物代谢分支的差异表达基因较多;1 806个差异表达基因预测为转录因子,共注释到57个转录因子家族,其中,bHLH家族最多。【结论】玛瑙红樱桃胚败育果实膨大期与转色期、成熟期的基因表达差异较大,转色期与成熟期基因表达差异变小,可在果实转色前筛选胚败育相关基因进行功能验证。
分类号: S662.5
- 相关文献
[1]'玛瑙红'樱桃胚败育果实和正常果实比较转录组分析. 宋莎,江旭升,金吉林,张绿萍,张敏. 2024
[2]玛瑙红樱桃胚败育果实和正常发育果实外观形态比较. 宋莎,刘方利,解璞,王恩权,张绿萍,金吉林. 2025
[3]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019
[4]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018
[5]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020
[6]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[7]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021
[8]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021
[9]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023
[10]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[11]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019
[12]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015
[13]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023
[14]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022
[15]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022
[16]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017
[17]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024
[18]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019
[19]红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析. 李荣妮,王赛赛,田仲,孙砚胜,张博,张欣. 2022
[20]基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究. 莫红芳,石宗承,杨燕燕,俸云,虞霖田,石德顺,熊晓妍. 2024
作者其他论文 更多>>
-
秸秆还田与施氮水平对大豆氮素吸收分配及产量的影响
作者:杨栗恒;尚磊;王孟雪;张云贵;张敏;王鹏
关键词:秸秆还田;氮素分配;大豆;产量
-
8个苹果砧木无融合生殖特性评价
作者:蒙小玉;黄欣艳;张绿萍;吴亚维
关键词:苹果砧木;无融合生殖;无融合生殖率
-
玛瑙红樱桃胚败育果实和正常发育果实外观形态比较
作者:宋莎;刘方利;解璞;王恩权;张绿萍;金吉林
关键词:玛瑙红樱桃;胚败育;果实;外观性状
-
二十三个离褶伞属菌株遗传多样性分析及分子身份证构建
作者:刘娜;宋莹;张敏;吕立涛;李跃;黄磊
关键词:离褶伞属;遗传多样性;SSR分子标记;DNA分子身份证
-
60Co-γ射线对大球盖菇的诱变效应及鉴定分析
作者:宋莹;刘娜;吕立涛;张季军;李跃;张敏
关键词:大球盖菇;诱变;生物学特性;营养成分
-
芥菜新品种华芥11号的选育及配套栽培技术
作者:吴双花;宁斌;李德超;王春丽;陈程程;张敏;常伟;毛海啸;万正杰
关键词:芥菜;华芥11号;品种选育;栽培技术
-
小麦扬麦18突变体库的构建及其表型变异分析
作者:杨彩仙;张敏;李博;张硕;徐乐;徐延浩
关键词:辐射诱变;高能混合粒子场;小麦;突变体库