玛瑙红樱桃不同发育时期胚败育果实转录组分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 宋莎

作者: 宋莎;江旭升;金吉林;张绿萍;张敏

作者机构:

关键词: 玛瑙红樱桃;胚败育;转录组测序;生育期;差异表达基因

期刊名称: 贵州农业科学

ISSN: 1001-3601

年卷期: 2025 年 53 卷 001 期

页码: 76-82

收录情况: 北大核心

摘要: 【目的】探明玛瑙红樱桃胚败育果实发育过程中相关基因的表达差异,为筛选胚败育相关基因提供理论依据。【方法】采用Illumina高通量测序技术,对不同发育时期(膨大期、转色期、成熟期)的玛瑙红樱桃胚败育果实样品进行转录组测序及相关分析。【结果】所有玛瑙红樱桃样品的高质量序列均在98%以上,映射序列均在85%以上,Q30均大于94%;共筛选出差异表达基因6 316个,其中,不同比较组共有差异表达基因1 207个;注释到GO的差异表达基因参与分子功能、细胞组分、生物过程等,参与生物过程最多;注释到KEGG通路的差异表达基因分别参与环境信息处理、生物体系统、遗传信息处理、细胞过程和新陈代谢5大通路的18个分支,注释到碳水化合物代谢分支的差异表达基因较多;1 806个差异表达基因预测为转录因子,共注释到57个转录因子家族,其中,bHLH家族最多。【结论】玛瑙红樱桃胚败育果实膨大期与转色期、成熟期的基因表达差异较大,转色期与成熟期基因表达差异变小,可在果实转色前筛选胚败育相关基因进行功能验证。

分类号: S662.5

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