非洲菊应答尖孢镰刀菌侵染的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 石乐娟

作者： 石乐娟;史雪叶;唐玲涵;李飞;杨胜俊;杨跃虎;刘晓周

作者机构：

关键词： 非洲菊;尖孢镰刀菌;根腐病;转录组;差异表达基因

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2024 年 37 卷 010 期

页码： 2233-2241

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】探明尖孢镰刀菌胁迫下非洲菊根系基因表达的变化，挖掘非洲菊根系抗病菌胁迫的相关基因及信号通路等分子机制，为非洲菊根腐病防治提供理论参考。【方法】以健康非洲菊根系和被尖孢镰刀菌侵染96 h感病的非洲菊根系为材料，采用转录组测序技术对其进行转录组测序，筛选差异表达基因(DEGs),并进行GO功能注释和KEGG代谢通路富集分析，再通过实时荧光定量PCR验证转录组测序结果的可靠性。【结果】从尖孢镰刀菌侵染非洲菊根系获得10 218个DEGs,其中上调基因7273个，下调基因2945个。有3401个DEGs隶属于72个转录因子家族，其中，数量最多的转录因子为MYB和AP2/EFR家族，其次为C2H2、bHLH、NAC和C3H等家族。GO富集结果显示，DEGs共注释到53个功能组，其中氧化还原过程、胞质溶胶、细胞分裂位点、膜组成成分、金属离子结合等的DEGs较多。KEGG代谢通路富集结果表明，DEGs显著富集在碳水化合物代谢、能量代谢、脂质代谢、氨基酸代谢等生物合成途径。3条碳水化合物代谢途径多数DEGs上调。光合作用途径和光合作用-天线蛋白途径中多数DEGs表现下调。在α-亚麻酸代谢途径中，共有49个差异表达基因被富集，其中4个脂氧合酶(LOX2S)基因和2个氢过氧化物脱水酶(AOS)基因均下调表达。【结论】MYB、AP2/EFR、C2H2、bHLH、NAC和C3H等转录因子家族成员以及调控光合作用、碳水化合物代谢、脂质代谢等相关差异表达基因，可能在参与响应非洲菊抗根腐病胁迫应答中发挥重要作用。

分类号： S436.8

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