不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李月
作者: 李月;王云龙;欧阳珑玲
作者机构:
关键词: 营浮游生活;虫黄藻;无机磷;转录组测序;差异表达基因
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2022 年 29 卷 004 期
页码: 585-595
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 浮游虫黄藻可与共生虫黄藻一起维持珊瑚群落的健康.前期研究表明1株营浮游生活的虫黄藻(Symbiodiniumsp.ECSFRI081109)在不同磷酸盐浓度培养下的生长速率和碱性磷酸酶活性有所差异.为了解其对不同磷酸盐浓度的响应机制,本研究利用RNA-Seq技术对高磷酸盐初始浓度(35 μmol/L)和低磷酸盐初始浓度(0.15 μmol/L)下不同培养时间(第0天、第5天和第10天)的虫黄藻进行转录组测序并做比较分析.结果显示:测序组装后获得80955个Unigenes,其中在NR、GO、KEGG、eggNOG、SwissProt以及Pfam数据库中共同注释的有4407个.对5个实验组的转录组数据进行比较分析,得到23个与磷利用相关的差异表达基因,主要有磷脂酶A2、磷脂酶B、磷脂酶C、磷脂酶D、碱性磷酸酶、酸性磷酸酶、无机磷酸盐转运体、Na+依赖型磷酸盐转运体、线粒体磷酸盐转运蛋白基因.根据不同磷酸盐初始浓度培养下上述基因的表达量变化,推测在低磷环境下,虫黄藻可通过增强对无机磷酸盐的转运能力及利用磷酸酶分解有机磷以缓解磷胁迫,从而维持细胞生长.本研究旨为深入了解浮游虫黄藻响应不同磷酸盐浓度的分子调控机制提供基础数据.
分类号: S917
- 相关文献
[1]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019
[2]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018
[3]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020
[4]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[5]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021
[6]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021
[7]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023
[8]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[9]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019
[10]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015
[11]转录组测序技术筛选安徽乌菜与普通白菜的差异表达基因. 王明霞,田红梅,江海坤,贾利,王艳,方凌. 2018
[12]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023
[13]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022
[14]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017
[15]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024
[16]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019
[17]转录组测序技术筛选安徽乌菜与普通白菜的差异表达基因. 王明霞,田红梅,江海坤,贾利,王艳,方凌. 2018
[18]红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析. 李荣妮,王赛赛,田仲,孙砚胜,张博,张欣. 2022
[19]基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究. 莫红芳,石宗承,杨燕燕,俸云,虞霖田,石德顺,熊晓妍. 2024
[20]西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析. 宋文菲,胡宗文,苗春辉,余玉生,杨爽,李亚辉. 2022
作者其他论文 更多>>
-
四种防治白粉病药剂对加州新小绥螨的安全系数和捕食功能影响
作者:谭德龙;王瑞;郑锦荣;王茹芳;郭金菊;曹海顺;王云龙;袁余;吴廷全
关键词:加州新小绥螨;病虫协同防治;设施农业;白粉病;捕食功能
-
牛肠道大肠杆菌的分离鉴定及耐药性分析
作者:郑启铭;梁纤纤;李晓卓;李月;刘文锴;韩翔舒;冯继红;翟少华;夏俊
关键词:犊牛腹泻;大肠杆菌;药敏试验;K99
-
临海东矶海域人工鱼礁大型底栖动物群落的早期发育
作者:李楠楠;毕远新;翁歆之;侯弘毅;程岩雄;范瑞良;陈渊戈;欧阳珑玲;全为民
关键词:海洋牧场;牡蛎礁;双壳贝类;猫爪牡蛎;饵料;演替
-
基于非靶向代谢组学分析两种酵母培养物的成分差异
作者:林青;时红玲;秦新政;李月;王子涵;高雁;曾军;王浩中;娄恺;霍向东
关键词:酵母培养物;非靶标代谢组学;差异代谢物;酿酒酵母
-
绵羊源溶血性曼氏杆菌A2型的分离鉴定及耐药性分析
作者:梁纤纤;郑启铭;李晓卓;冯继红;李月;刘文锴;韩翔舒;阿卜杜热合曼·努尔麦麦提;苏战强;夏俊
关键词:溶血性曼氏杆菌;绵羊源;血清型
-
辣椒苗期炭疽菌接种方法
作者:李月;余婉贤;李宁;姚明华;李峰;邓颖天
关键词:辣椒;苗期;炭疽菌;接种方法
-
江苏启东潮间带滩涂底栖贝类生物多样性及分布格局
作者:李楠楠;范瑞良;陈渊戈;欧阳珑玲;姜伟行;全为民
关键词:潮间带;底栖贝类;生物多样性;分布格局;启东