工业大麻ZF-HD转录因子的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 翟莹

作者： 翟莹;高双;王志刚;赵明;祁宏英;马天意;张军;李珊珊

作者机构：

关键词： 工业大麻;ZF-HD转录因子;生物信息学分析;干旱胁迫;盐胁迫

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2024 年 006 期

页码： 1188-1195

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】对工业大麻ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)转录因子进行鉴定和表达模式分析，为ZF-HD功能研究及工业大麻遗传性状的改良提供理论参考。【方法】对5个工业大麻ZF-HD转录因子的基因结构、蛋白理化性质、蛋白系统进化关系和启动子顺式作用元件进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对基因表达量进行检测。【结果】5个CsZF-HD基因分布于大麻基因组的2条染色体上，其编码序列长度为783～1185 bp,编码260～394个氨基酸残基，蛋白分子量为27.95～43.33 ku,理论等电点为7.46～8.87。它们编码的蛋白均含有1个保守的ZF-HD＿dimer结构域，均为不稳定的亲水性蛋白且定位于细胞核中。ZF-HD蛋白家族分为3个亚族(A、B和C),CsZF-HD1和CsZF-HD2属于A亚族，CsZF-HD3属于C亚族，CsZF-HD4和CsZF-HD5属于B亚族。CsZF-HD1和CsZF-HD2在茎和叶中的表达量相差不明显，在根中表达量最低；CsZF-HD3在茎中的表达量最高，叶中表达量最低；CsZF-HD4在叶中的表达量最高，根中表达量最低；CsZF-HD5在根中表达量最高，茎中表达量最低。5个CsZF-HD基因均对盐和干旱胁迫响应，其中CsZF-HD1和CsZF-HD3在盐和干旱胁迫下表达量升高最明显。5个CsZF-HD基因启动子序列中均含有不同种类和数量的逆境相关顺式作用元件。【结论】ZF-HD转录因子可能在工业大麻应对盐和干旱胁迫时发挥转录调控作用。

分类号： S563.3

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