甘蔗铁氧还蛋白基因cDNA的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 宋喜梅

作者: 宋喜梅;黄峰;姚全胜;郑良永;陈由强

作者机构:

关键词: 甘蔗;铁氧还蛋白;基因克隆;序列分析

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2011 年 32 卷 11 期

页码: 2076-2079

收录情况: CSCD

摘要: 以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR扩增铁氧还蛋白(ferredoxin,Fd)基因的cDNA,构建到pMD18-T载体后进行序列测定和序列分析。结果表明:①克隆得到的cDNA片段长度为688 bp,包含甘蔗Fd基因完整的开放读码框,编码151个氨基酸,其中酸性氨基酸残基较多,76~101的氨基酸序列高度保守;②甘蔗与玉米Fd基因cDNA序列的同源性为93.68%,氨基酸序列同源性为95.39%;③该基因推导的蛋白分子量大小为16.05 ku,理论等电点为4.72,疏水性分值在-2.567~1.344之间,蛋白二级结构中,α-螺旋占13.9%,β-折叠占25.8%,无规则卷曲占60.3%。将得到的序列命名为Fd1,GenBank登录号为GU320210.1。

分类号: S566.1

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