草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 段盛文

作者： 段盛文;刘正初;郭刚;冯湘沅;郑科;成莉凤

作者机构：

关键词： 草本纤维;产芽孢菌株;PCR-16S rDNA;ITS-RFLP

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2009 年 48 卷 09 期

页码： 2052-2054+2098

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16～23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析。结果表明,8株菌株分别属于地衣芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌;基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;AluⅠ、HinfⅠ、Sau3AⅠ、TaqⅠ4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0～4条100～440bp的酶切产物。

分类号： Q939.124

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