辣椒炭疽病病原菌中分泌蛋白的预测及特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李明瑾

作者： 李明瑾;霍建飞;韩长志;姚玉荣;贲海燕;郝永娟;王万立

作者机构：

关键词： 辣椒炭疽病病原菌;分泌蛋白;生物信息学分析

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2025 年 41 卷 001 期

页码： 41-50

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 由辣椒炭疽病病原菌引起的辣椒炭疽病严重危害着中国辣椒产业的健康发展。分泌蛋白作为炭疽病病原菌中重要的致病因子，能帮助病原菌侵入寄主组织、分解寄主细胞壁，为病原菌生存和繁殖提供条件。然而，学术界尚缺乏对辣椒炭疽病病原菌中分泌蛋白的深入解析和研究。本研究基于前期获得的辣椒炭疽病病原菌强致病菌株TJNH1全基因组序列，充分利用SignalP、ProtComp等生物信息学分泌蛋白预测软件，对该病菌中13 419条蛋白质氨基酸序列进行预测，同时，基于转录组测序数据，对上述分泌蛋白的功能及特性展开研究。结果表明，辣椒炭疽病病原菌菌株TJNH1中含有388个分泌蛋白，占总蛋白质数量的2.89%,分泌蛋白氨基酸序列长度介于55 aa至730 aa,非极性氨基酸丙氨酸(Ala)在分泌蛋白里使用频率最高，分泌蛋白信号肽长度集中于17 aa至21 aa,信号肽切割位点为A-X-A型。分泌蛋白均为亲水性蛋白，高亲水性氨基酸和高疏水性氨基酸数量最多的分别是天冬酰胺(Asn)和丙氨酸(Ala),分泌蛋白大多为稳定、酸性蛋白。同时运用SMART、eggNOG、STRING V11.5等软件对上述分泌蛋白的保守结构域、COG功能分类、蛋白质互作关系等进行分析，有152个分泌蛋白具有明显的保守结构域，163个分泌蛋白获得了功能注释，32个分泌蛋白存在互作关系。该研究结果为明确分泌蛋白的功能和辣椒炭疽病病原菌的致病机理提供了理论支撑，也为筛选以分泌蛋白为靶标的新型农药和辣椒炭疽病绿色防控提供了理论依据。

分类号： S436.418.11

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