基于线粒体COI和D-loop序列的黑龙江流域蛇(鱼句)种群遗传结构分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 胡宗云
作者: 胡宗云;杨培民;宋红梅;牟希东
作者机构:
关键词: 蛇(鱼句)(Saurogobio dabryi);COI;D-loop;遗传多样性;遗传结构
期刊名称: 淡水渔业
ISSN: 1000-6907
年卷期: 2023 年 002 期
页码: 12-20
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以线粒体COI和D-loop序列为分子标记,基于88个样本研究了黑龙江流域3个蛇(鱼句)(Saurogobio dabryi)种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明,比对剪切后的COI和D-loop序列长度分别为582~583 b、834~583 b,基于COI序列总体的单倍型多样性(0.377 3)略低于基于D-loop序列的单倍型多样性(0.577 0),但基于两个序列总体的核苷酸多样性指数相等,且仅有0.000 9。群体间遗传距离分别为0.000 9(COI)和0.000 9~0.001 0(D-loop),群体间遗传分化指数分别为-0.004 9~0.007 6(COI)和-0.002 8~0.011 4(D-loop),遗传分化均不显著(P>0.05)。分子方差分析(AMOVA)显示,群体内遗传变异占总变异的100.02%(COI)和99.49%(D-loop),总的遗传变异主要源自群体内。单倍型系统发育树和TCS网络图表明,所有的单倍型随机地聚集在一起,没有形成明显的地理格局。中性检验和核苷酸错配分析显示,3个蛇(鱼句)群体历史上发生过种群扩张事件。综上,3个蛇(鱼句)群体遗传多样性水平相对较低,群体间没有显著的遗传分化,可以将3个群体视为一个遗传管理单元。这些发现将丰富蛇(鱼句)现有的遗传信息,并为制定黑龙江流域蛇(鱼句)资源保护策略提供参考。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]基于COI序列的长江中上游鲢6个地理群体遗传多样性分析. 沙航,罗相忠,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 2018
[2]长江上游中华纹胸鮡遗传多样性及遗传结构研究. 张力文,田辉伍,陈大庆,刘绍平,段辛斌,汪登强. 2020
[3]基于线粒体COI基因的中华鳖3个品系遗传多样性分析. 梁宏伟,曹力欢,罗相忠,朱成骏,崔峰,邹桂伟. 2021
[4]基于线粒体控制区的中国近海棘头梅童鱼群体遗传结构研究. 梁述章,宋炜,马春艳,蒋科技,张凤英,赵明,马凌波. 2019
[5]基于Cytb与D-loop的罗非鱼选育群体遗传结构对比分析. 颉晓勇,钟金香,李思发. 2014
[6]栉孔扇贝、虾夷扇贝及其杂交子代线粒体COI和Cytb基因遗传多样性分析. 于涛,吴彪,杨爱国,周丽青,刘志鸿. 2016
[7]基于线粒体16S rRNA和COI序列的江苏启东海域4种贝类遗传多样性分析. 闫永斌,葛玉双,程起群,范瑞良,李楠楠,全为民. 2022
[8]东黄海沙海蜇群体线粒体COI基因序列多态性. 刘敏,程家骅,马凌波,凌建忠,李建生. 2010
[9]我国不同地理群体栉江珧遗传多样性及系统发生分析. 严加坤,杨爱国,周丽青,吴彪,白临建,刘志鸿. 2013
[10]基于COI序列比较中国和科威特养殖鲳鱼群体的遗传差异. 孙鹏. 2015
[11]广东省二化螟越冬地理种群发生水平、遗传多样性及系统发育分析. 袁龙宇,吴阳刚,钟文东,李燕芳,戴阳朔,张振飞,肖汉祥. 2025
[12]贵州3个地方猪种的mtDNA D-loop序列遗传多样性分析. 陈祥,丁玫,孙鹃,尚以顺,柏琳. 2015
[13]长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析. 程起群,吕浩,逄娇慧,赵金良. 2019
[14]西藏部分山羊群体线粒体DNA D-loop区遗传多样性及系统进化分析. 黄兴,柴志欣,信金伟,王会,王吉坤,姬秋梅,钟金城. 2019
[15]长江流域4个野生大眼鳜群体的遗传多样性分析. 程起群,吕浩,逄娇慧,赵金良. 2019
[16]西藏牛亚科部分群体线粒体DNA遗传多样性研究. 黄兴,柴志欣,信金伟,王会,王吉坤,姬秋梅,钟金城. 2019
[17]基于线粒体D-loop区序列和Cyt b基因的鲟鱼群体遗传多样性分析. 孔杰,刘伟,李世凯,周洲,赵凤. 2020
[18]基于线粒体D-loop区序列和Cyt b基因的觸鱼群体遗传多样性分析. 孔杰,刘伟,李世凯,周洲,赵凤. 2020
[19]中国达氏鳇野生群体和两个养殖群体的线粒体遗传多样性分析. 户国,程磊,马波,孙大江,王斌,刘晓勇,柳淑芳,张颖. 2018
[20]基于多个线粒体序列的中韩俄沿海不同地理群体刺参的遗传多样性及种群结构分析. 王锦锦,廖梅杰,李彬,王印庚,荣小军,张正,葛建龙. 2020
作者其他论文 更多>>
-
不同大口黑鲈群体耐热性分析及高温对鳃组织和抗氧化酶活性的影响
作者:谢玉净;李胜杰;杜金星;朱涛;宋红梅;雷彩霞;温绮乔
关键词:大口黑鲈;急性高温胁迫;半数致死温度;组织损伤;抗氧化酶
-
饲料中添加色氨酸和蛋氨酸对中华绒螯蟹生长性能、消化能力、免疫功能及抗氧化能力的影响
作者:蒋湘辉;王兴兵;李赫;胡宗云;张健;魏洪祥;杨培民
关键词:中华绒螯蟹;色氨酸;蛋氨酸;生长;体成分;消化酶;免疫功能;抗氧化能力
-
大洋河刀鲚性腺发育组织学观察
作者:刘忠航;杨培民;张健;张伯序;朱春月;胡宗云
关键词:大洋河;刀鲚;卵子发生;精巢;组织学
-
稻田混养异育银鲫对稻蟹综合种养系统微生物群落结构的影响
作者:李赫;胡宗云;肖祖国;封岩;吴丽娜;李敬伟;闫有利
关键词:中华绒螯蟹;异育银鲫“中科3号”;养殖密度;微生物群落结构;高通量测序
-
草鱼不同月龄性腺组织学观察及性别特征基因cyp19a1a和amh的表达分析
作者:祁博;李胜杰;杜金星;肖小芳;张东云;朱涛;雷彩霞;刘志军;宋红梅
关键词:草鱼;性别分化;组织切片;基因表达
-
辽宁地区不同生境中华绒螯蟹肠道微生物群落研究
作者:刘忠航;杨培民;张健;张伯序;朱春月;胡宗云
关键词:中华绒螯蟹;高通量测序;宏基因组;肠道菌群;生境
-
利用微卫星标记对6个鲤群体的遗传多样性分析
作者:封岩;闫有利;贾智英;李池陶;姜晓娜;杨培民;吴丽娜;肖祖国;张健;李敬伟
关键词:鲤;微卫星;遗传多样性;亲缘关系鉴定
