不同生物型BVDV感染宿主细胞后差异基因分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 程凯慧

作者: 程凯慧;朱彤;侯佩莉;王洪梅;苗自利;张亮;解晓莉;杨宏军;何洪彬

作者机构:

关键词: 致细胞病变型BVDV;非致细胞病变型BVDV;差异基因;GO功能分析;Pathway显著性分析

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2017 年 11 期

页码: 3113-3120

收录情况: 北大核心

摘要: 为深入研究牛场中普遍存在的持续性感染,探讨不同生物型牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)转化的分子机制,本试验将致细胞病变型BVDV(CP型BVDV)和非致细胞病变型BVDV(NCP型BVDV)感染MDBK细胞,观察细胞变化,感染后12~72h期间每间隔12h收集1次细胞,同时对24、48h收集的细胞进行转录组学分析。结果显示,不同生物型BVDV感染宿主细胞24h后,与感染NCP型BVDV的细胞相比,感染CP型BVDV的MDBK细胞中上调差异表达的基因2 849个,下调差异表达的基因3 347个,48h后,上调差异表达的基因2 933个,下调差异表达的基因2 831个。对差异基因的GO功能分析结果表明,差异基因参与的分子功能主要有催化活性、结合活性、酶调节活性、分子转导活性和蛋白结合转录因子活性等;Pathway显著性富集分析结果显示,差异表达基因主要参与细胞自噬、细胞凋亡、免疫调节因子等相关的信号通路。本试验结果可为进一步揭示病毒致病的分子机制、控制BVDV和研制其候选疫苗奠定基础。

分类号: S852.65

  • 相关文献

[1]禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析. 汪最,孔令严,邵华斌,卢琴,罗青平. 2018

[2]沪农灵芝1号全基因组分析和演化比较. 龚明,鲍大鹏,唐传红,张劲松. 2016

[3]金针菇单核体DAN3和M与其杂交双核体G1菌丝阶段基因表达差异的转录组初步分析. 徐珍,刘建雨,张丹,王瑞娟,潘迎捷,谭琦,尚晓冬. 2016

[4]光照胁迫下广叶绣球菌菌丝基因差异表达的初步分析. 肖冬来,张迪,马璐,王宏雨,林衍铨. 2017

[5]禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析. 孔令严,罗青平,卢琴,邵华斌,李槿年. 2017

[6]禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析. 孔令严,汪最,邵华斌,张腾飞,卢琴,罗青平. 2019

[7]辣椒幼苗灌根接种疫霉菌侵染后叶片基因差异表达谱分析. 宋虎卫,罗德旭,张云峰. 2015

[8]大麦白化颖壳突变体的转录组学分析. 栾海业,臧慧,沈会权,张英虎,乔海龙,陶红,申玉香,陈和. 2017

[9]宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析. 张保青,宋修鹏,陈虎,杨丽涛,李杨瑞,陈保善. 2013

[10]差异基因的高通量筛选研究. 刘岩,王海龙,孟智启. 2009

[11]糙皮侧耳发酵玉米秸秆转录组揭示木质素降解相关途径. 马蕊,赵飞,范寰. 2017

[12]胸膜肺炎放线杆菌血清1型与5型基因组DNA差异基因的筛选与鉴定. 谢芳,韩文瑜,杜崇涛,周靓,杨舒心,雷连成. 2010

[13]棉铃虫Bt抗感品系的转录组差异表达分析. 刘运泽,张丹丹,曲爱军,郑方强,萧玉涛. 2019

[14]不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨. 成启明,格根图,撒多文,王志军,范文强,卜振鲲,司强,李俊峰,卢娟,贾玉山. 2019

[15]不同MHC-DRB1单倍型哈萨克绵羊感染包虫病初期小肠组织差异表达基因筛选与分析. 李鑫,惠文巧,蒋松,贾斌,张永生,申红,李洪涛,王绪海,韩国华. 2015

[16]干旱胁迫下两个玉米自交系雄穗花器官分化期的转录组分析. 王业建,杨杰,梁晓玲,阿布来提·阿布拉,韩登旭,郗浩江,刘俊,李铭东. 2020

[17]低温胁迫下海滨木槿的转录组分析. 赵文静,郑旭,葛金涛,刘兴满,缪美华,孔祥伟. 2023

[18]狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析. 李国辉,曹愉夏,薛倩,张会永,殷建玫,朱云芬,沈海玉,窦新红,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威. 2021

[19]'重瓣红'玫瑰不同花发育阶段转录和代谢差异分析. 赵艳侠,张晶莹,孙骏飞,王绛辉,孙家波,吕晓惠. 2023

[20]早熟砂梨‘苏翠1号’与其亲本‘翠冠’‘华酥’成熟果实差异代谢产物及差异基因比较分析. 王宏,杨王莉,蔺经,杨青松,李晓刚,盛宝龙,常有宏. 2022

作者其他论文 更多>>