碱蓬PEAMT基因的克隆及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 金杭霞
作者: 金杭霞;董德坤;杨清华;袁凤杰;郁晓敏;傅旭军;朱丹华
作者机构:
关键词: 碱蓬;Sg PEAMT基因;荧光定量PCR;生物信息学
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2015 年 31 卷 09 期
页码: 178-183
收录情况: CSCD
摘要: 研究旨在克隆碱蓬的耐逆相关基因——磷酸乙醇胺甲基转移酶(phosphoethanolamine N-methyltransferase,PEAMT)的编码基因,分析PEAMT基因调控机制,为进一步研究PEAMT基因的功能和碱蓬的耐盐机制奠定分子基础。依据Gen Bank数据库发表的其他物种的PEAMT序列设计简并引物,通过降落PCR法获得碱蓬PEAMT基因全长c DNA,命名为Sg PEAMT,生物信息学软件分析其序列特点,荧光定量PCR检测其表达特性。序列分析表明Sg PEAMT基因开放阅读框为1485 bp,编码494个氨基酸,推测其为亲水性蛋白。保守结构域分析表明,Sg PEAMT含有2个独立的S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶的保守结构域,每个结构域含有4个基序。系统进化树分析确认Sg PEAMT与同属的碱蓬属植物亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析显示,盐胁迫或ABA胁迫下碱蓬根、茎、叶中Sg PEAMT基因的表达上调,特别是叶中表达量最高。研究结果表明,Sg PEAMT基因受Na Cl和ABA诱导表达,预示Sg PEAMT基因可能在碱蓬对盐胁迫的反应中起重要作用,是一种参与碱蓬耐盐反应的有效耐逆基因,为植物基因工程提供有效的耐逆基因。
分类号: Q943.2
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