樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒VP3基因的克隆与序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 万春和
作者: 万春和;刘荣昌;程龙飞;傅光华;傅秋玲;施少华;陈红梅;黄瑜
作者机构:
关键词: 鹅出血性多瘤病毒;樱桃谷鸭;VP3基因;克隆;序列分析
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2017 年 44 卷 04 期
页码: 980-985
收录情况: 北大核心
摘要: 为明确福建地区是否存在鹅出血性多瘤病毒(goose hemorrhagic polyomavirus,GHPV)感染,本研究对2016年福建省临床送检测19份鸭组织样品进行GHPV检测,结果从1例樱桃谷鸭中检测到GHPV感染阳性(记为GHPV-FJ201601株)。随后根据GenBank中GHPV参考株序列特征,设计针对GHPV的VP3基因特异性引物,利用PCR技术扩增获得GHPV的VP3基因片段。结果显示,GHPV-FJ201601株的VP3基因全长为654bp,编码217个氨基酸。对编码的VP3蛋白分析发现其理论等电点为9.37,带负电荷氨基酸为23个(Asp+Glu),带正电荷氨基酸为28个(Arg+Lys);不稳定指数为38.43,是一个稳定蛋白;脂肪系数64.33,总平均疏水性指数为-0.744;该蛋白无典型的信号肽切割位点;其亚细胞定位类型为核定位;对其进行磷酸化分析发现,该蛋白存在14个氨基酸磷酸化位点。核苷酸同源性分析显示,不同来源GHPV代表株VP3基因相互之间核苷酸同源性均较高,均不低于99.7%。VP3基因遗传进化结果显示,GHPV-FJ201601株和鹅源GHPV分离株(匈牙利14234株与法国Toulouse Goose 2000株)处于同一遗传进化分支,与鸭源分离株(法国Toulouse Muscovy Duck 2008株、法国Toulouse Mule Duck 2008和中国106株)却处于不同的遗传进化分支,但所有GHPV分离株VP3基因遗传进化均较近。本研究首次证实福建地区樱桃谷鸭群中存在GHPV感染,为丰富不同地区与宿主的GHPV分子流行病学数据提供参考。
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]三株鹅细小病毒VP3基因的克隆和序列研究. 曹宗喜,叶保国,林哲敏,张桂红. 2013
[2]Ⅰ型鸭肝炎病毒VP3基因的克隆及原核表达. 李露,程英杰,李传峰,陈宗艳,孟春春,何后军,刘光清. 2013
[3]番鸭细小病毒VP3基因克隆和序列分析. 张丹俊,戴银,沈学怀,赵瑞宏,胡晓苗,侯宏艳,潘孝成,周学利. 2015
[4]鸡贫血病病毒长春株VP3基因的克隆及序列分析. 宋秀龙,章金刚,常国权,陈奖励. 2001
[5]鸭肝炎病毒Ⅰ型VP3基因的克隆及原核表达. 刘家森,甘一迪,姜骞,孟庆文,韩凌霞,司昌德,刘娣,曲连东. 2008
[6]鸭病毒性肝炎病毒VP3基因的克隆与表达. 李峰,吴静,林树乾,于可响,马秀丽. 2008
[7]禽脑脊髓炎病毒VP3基因的克隆与序列测定. 张立成,关云涛,杨增岐,陈洪岩,王云峰. 2004
[8]鹅细小病毒VP3基因的克隆及表达. 孙敏华,董嘉文,李林林,袁建丰,邝瑞欢,胡奇林. 2013
[9]鸡传染性支气管炎病毒两个地方分离株S1基因的扩增克隆与序列分析. 戴亚斌,陈德胜,潘杰彦,姜焱,刘兴友,芦银华,刘梅,丁铲,陈溥言,蔡宝祥. 2002
[10]羊肌细胞生成素基因的克隆及序列分析. 邓凤,荣威恒. 2012
[11]长顺绿壳蛋鸡PRL基因的克隆及序列分析. 韩雪,朱丽莉,粟朝芝,吴松成,陶宇航. 2016
[12]山药Actin基因片段的克隆及表达分析. 周芸伊,王爱勤,罗海玲,何龙飞. 2016
[13]猪氨基酸转运载体b~(0,+)AT-2的分子克隆及其序列分析. 职爱民,冯定远,周响艳,黄志毅,邹仕庚,王修启,左建军,叶慧,王小兰,刘准. 2009
[14]贵州黑山羊RERG基因cDNA克隆与序列分析. 朱冠群,杨红文,罗卫星,韩勇,刘若余,陈志. 2013
[15]马立克氏病病毒河南分离株Meq基因的克隆与序列分析. 余祖华,滕蔓,丁轲,闵亚杰,禹乐乐,宿靖伟,程相朝,罗俊. 2014
[16]木薯Actin基因片段的克隆及序列分析. 罗兴录. 2011
[17]猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF6基因的克隆与序列分析. 王鼎元,杜平,刘学荣,黄银君,牟克斌. 2015
[18]不同寄主植物上芜菁花叶病毒外壳蛋白基因克隆及分析. 张成玲,赵永强,杨冬静,孙厚俊,徐振,谢逸萍. 2014
[19]水稻细菌性谷枯病菌的分子鉴定及16S rDNA序列分析. 周求根,兰波,徐沛东,李湘民,杨迎青. 2014
[20]环颈雉和花尾榛鸡MC4R基因的克隆和序列分析. 杨秀芹,张冬杰,刘娣. 2010
作者其他论文 更多>>
-
福建省多黏菌素耐药基因mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的流行性及耐药性分析
作者:戴婷婷;陈海玉;段楚楚;庄丽云;刘荣昌;陈慧慧;余小珍;杨欣;陈梦诗;包银莉;程艳青;华宝玉;黄翠琴;郑新添
关键词:大肠杆菌;多黏菌素;耐药基因;mcr-1;福建;鸡
-
藏猪的基因组重测序初步分析
作者:赵梦诗;普布扎西;李兆龙;施少华;赵红阳;李沛民;周彪;邱金华
关键词:藏猪;基因组;重测序
-
鸡源携带多黏菌素耐药基因mcr-1大肠杆菌耐药性与毒力基因相关性分析
作者:戴婷婷;陈海玉;段楚楚;刘荣昌;李宇蓉;严淑涵;陈梦诗;刘露薇;包银莉;程艳青;林炜明;黄翠琴;郑新添
关键词:大肠杆菌;多黏菌素;mcr-1基因;耐药性;毒力基因;接合试验
-
尾丝蛋白在噬菌体吸附鸭疫里默氏菌中的作用
作者:刘娜;黄瑜;陈红梅;江南松;刘荣昌;傅光华;傅秋玲;梁齐章;万春和;李昂;程龙飞
关键词:鸭疫里默氏菌;噬菌体;尾丝蛋白;吸附
-
鸡圆圈病毒3型SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立与应用
作者:牛群;庄丽云;雷天宇;戴婷婷;孟庆福;刘荣昌;何华;郑新添
关键词:圆圈病毒3型;VP2基因;实时荧光定量PCR
-
鸭疫里默氏菌噬菌体宿主谱的拓宽
作者:程龙飞;江南松;刘荣昌;傅秋玲;梁齐章;万春和;黄瑜;傅光华;陈红梅
关键词:鸭疫里默氏菌;噬菌体;噬菌谱;拓宽
-
鸭传染性浆膜炎疑似病例肝脑RA分离株的血清型鉴定及药敏性测定与分析
作者:彭春香;郑小兰;程龙飞
关键词:鸭;传染性浆膜炎;血清型鉴定;药敏试验