鸭肝炎病毒浙江分离株全基因组测序及其VP1基因的序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邵泽香

作者： 邵泽香;韦强;鲍国连;崔言顺;刘燕;王春平;季权安;李建亮

作者机构：

关键词： Ⅰ型鸭肝炎病毒;VP1基因;RT-PCR;序列分析

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2010 年 30 卷 08 期

页码： 1052-1055

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术及RACE方法扩增得到鸭肝炎病毒(DHV)浙江分离株Z10的全基因(5′,3′末端序列用RACE法扩增)及4株DHV分离株的VP1基因。结果表明,分离株Z10的全基因片段长7 689 bp,有1个大的开放读码框(ORF),ORF位于626~7 326位核苷酸,编码2 249个氨基酸。Z10分离株全基因序列与GenBank登录的6株具有代表性的DHV核苷酸序列比对,同源性94.5%~98.4%;所测得的DHV分离株的VP1基因的序列与目前GenBank上发表的具有代表性的DHV-ⅠVP1基因进行比对分析,结果4株Ⅰ型DHV的VP1基因cDNA长度均为714 bp,编码238个氨基酸。4株DHV-Ⅰ之间VP1基因的核苷酸序列同源性为93%~99.7%,氨基酸序列同源性为95.0%~100%;与参考毒株VP1基因的核苷酸序列同源性为92.2%~100%,氨基酸序列同源性为95.0%~100%;表明各分离毒株的亲缘关系较近,属于同一基因群。

分类号： S852.65

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