企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 施少华

作者： 施少华;黄瑜;程龙飞;傅光华;陈红梅;陈珍;苏敬良

作者机构：

关键词： 企鹅;禽1型副黏病毒;全基因组;序列测定;功能基因分析

期刊名称： 中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2009 年 31 卷 16 期

页码： 10-14

收录情况： 北大核心

摘要： 为了从分子水平上探讨企鹅源禽1型副黏病毒BP01的演化,根据GenBank登录的鹅源禽1型副黏病毒基因序列设计引物,运用RT-PCR方法于国内外首次测定了企鹅源禽1型副黏病毒全基因组序列,其全长为15192nt。经分析表明BP01病毒基因组与SF02株和ZJ1株等鹅源禽1型副黏病毒同源性最高,分别为99.1%和99.0%;与IT-227/82和dove/Italy/2736/00等鸽源禽1型副黏病毒同源性分别为90.2%和88.1%;而与Hert/33和LaSota等鸡源禽1型副黏病毒的同源性最低,仅分别为87.9%和83.2%。对F基因第47～435nt进行系统进化树分析和F基因第334～1682nt进行HinfⅠ、BstOⅠ、RsaⅠ酶切位点分析,确定BP01株病毒为基因Ⅶ型。F蛋白裂解位点氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,符合禽1型副黏病毒强毒株的特性,经预测发现BP01株病毒F蛋白的七肽重复序列分别在第143～189位氨基酸残基和第461～503位氨基酸。通过对主要毒力基因推导的氨基酸序列进行比较发现,水禽源与其它源F蛋白有14个氨基酸不同,HN蛋白上有2个氨基酸的不同,而P蛋白有20个氨基酸的不同,且在第151～166位氨基酸存在一个明显的突变域。

分类号： S852.65

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