夏南牛MFSD13A基因多态性及其与生产性状的关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王香南
作者: 王香南;张子敬;吕世杰;陈付英;祁兴山;杨广礼;王冠;王二耀
作者机构:
关键词: 夏南牛;插入/缺失;MFSD13A基因;关联分析;组织表达谱
期刊名称: 黑龙江畜牧兽医
ISSN: 1004-7034
年卷期: 2025 年 009 期
页码: 48-54
收录情况: 北大核心
摘要: 为了研究主要促进因子超家族成员13A(major facilitator superfamily domain containing 13A,MFSD13A)基因第一内含子区21 bp和第二外显子区19 bp插入/缺失(insertion/deletion, indel)变异对夏南牛生长性状的影响,试验以夏南牛、郏县红牛和南阳牛等12个品种为研究对象,采用PCR、琼脂糖凝胶电泳和实时荧光定量PCR等方法检测MFSD13A基因40 bp indel基因分型及MFSD13A基因组织表达分析,通过牛基因型-组织表达(genotype-issue expression, GTEx)数据分析40 bp indel变异对MFSD13A基因表达的影响。结果表明:MFSD13A基因上游存在完全连锁平衡的21 bp与19 bp两个indel变异;40 bp indel等位基因型频率在12个品种(群体)中I等位基因频率高于D等位基因且属于中度或低度多态,并在夏南牛、郏县红牛、南阳牛、皖东牛、大别山牛和德南牛品种中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);MFSD13A基因40 bp indel位点与夏南牛和南阳牛的体重、体高和胸围均呈显著相关(P<0.05);肾脏和脂肪组织中MFSD13A基因的相对表达量显著高于其他组织(P<0.05);II基因型个体MFSD13A基因的mRNA表达量显著高于ID和DD基因型(P<0.05)。说明MFSD13A基因突变对夏南牛生长性状有显著影响,可作为夏南牛优良性状选育的候选分子标记。
分类号: S823
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