柑橘CjGH3.4和CjGH3.7基因的生物信息学分析及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 庞少萍

作者： 庞少萍;谢让金;马岩岩;钱春;何绍兰;易时来;吕强;郑永强;邓烈

作者机构：

关键词： 柑橘;植物激素;逆境;GH3;基因表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2015 年 42 卷 12 期

页码： 2362-2372

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以资阳香橙(Citrus junos Sieb.ex Tanaka)为材料,基于柑橘全基因组对两个生长素酰胺合成酶基因GH3(Gretchen Hagen 3),即Cj GH3.4和Cj GH3.7进行生物信息学分析及表达分析。结果表明:Cj GH3.4的开放阅读框(ORF)长度为1 830 bp,编码609个氨基酸;Cj GH3.7的ORF为1 800 bp,编码599个氨基酸。基因结构分析显示Cj GH3.4含有两个内含子,Cj GH3.7含有3个内含子。通过比对发现,这两个基因编码的蛋白序列与拟南芥、水稻、大豆、杨树等具有的较高的同源性,相似度可达66%~81%。Cj GH3.7主要在叶组织中表达,Cj GH3.4在根和叶组织中表达均较高,且叶高于根。在根和叶组织中,Cj GH3.4和Cj GH3.7均受低温、高盐以及PEG胁迫诱导,表明其参与了柑橘逆境响应过程。Cj GH3.4和Cj GH3.7在叶中受到ABA、ACC、Me JA和SA等诱导,在根中却受到抑制,呈现相反的表达模式。

分类号： S666

  • 相关文献

[1]柑橘转录因子基因CitMYB22的分离、表达及亚细胞定位分析. 李永杰,马岩岩,谢让金,何绍兰,易时来,吕强,郑永强,王武,邓烈. 2016

[2]柑橘半胱氨酸蛋白酶基因CsCysP的分离、亚细胞定位及表达分析. 张军,陈娇,张凌云,朱世平,闫树堂,钟广炎. 2014

[3]巴西橡胶树HbMlo1-1基因克隆及其表达. 何海霞,张宇,王萌,李晓娜,杨叶. 2016

[4]海南普通野生稻OrERF1的克隆和表达分析. 徐靖,王效宁,韩义胜,熊怀阳,严小微. 2014

[5]水稻干尖线虫海藻糖酶Ab-tre-1基因克隆与逆境条件下的表达分析. 陈曦,冯辉,束兆林,姚克兵,魏利辉. 2016

[6]海南普通野生稻OrNAC5的克隆和表达分析. 徐靖,严小微,熊怀阳,朱红林,韩义胜. 2014

[7]宽皮柑橘果实的剥皮性及与细胞壁多糖的关系. 张晓楠,余歆,叶子茂,刘小丰,朱延松,杨胜男,王旭,刘梦雨,赵晓春. 2021

[8]柑橘CitPG34的克隆、定位与表达分析. 葛廷,黄雪,谢让金. 2019

[9]柑橘CitCEP基因家族的鉴定及对逆境和激素的响应. 潘小婷,张静,葛廷,马岩岩,邓烈,何绍兰,易时来,郑永强,吕强,谢让金. 2018

[10]柑橘黄龙病相关水杨酸羧基甲基转移酶基因CsSAMT-1的克隆与表达分析. 白晓晶,许兰珍,贾瑞瑞,周鹏飞,陈敏,何永睿,彭爱红,雷天刚,李强,姚利晓,陈善春,邹修平. 2017

[11]柑橘CitMYB40转录因子的克隆与表达分析. 董翠翠,庞少萍,马岩岩,谢让金,邓烈. 2017

[12]柑橘CitERF9和CitAP2-7在不同逆境和外源激素处理下的表达. 董翠翠,马岩岩,谢让金,邓烈,易时来,吕强,郑永强,何绍兰. 2016

[13]CsAREB转录因子在柑橘果实发育中的作用. 庞少萍,董翠翠,马岩岩,钱春,何绍兰,谢让金,邓烈. 2017

[14]响应黄龙病侵染的柑橘乙醇脱氢酶基因CsADH1的克隆与表达分析. 谢竹,赵珂,郑林,龙俊宏,杜美霞,何永睿,陈善春,邹修平. 2020

[15]柑橘低氧应答基因CsHRP的克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈娇,马岩岩,张军,杨雪莲,钟广炎,朱世平,陆智明. 2016

[16]柑橘U-box基因家族的鉴定及表达分析. 李秋月,张亚飞,彭洁,王旭,张志强,戴祥生,江东. 2019

[17]柑橘响应黄龙病侵染的韧皮部蛋白2基因CsPP2B15的克隆与表达分析. 文庆利,谢竹,吴柳,何永睿,陈善春,邹修平. 2018

[18]CBL-CIPK信号系统在植物应答逆境胁迫中的作用与机制. 张俊文,魏建华,王宏芝,王彦珍,马荣才. 2008

[19]耐超高压胁迫副溶血性弧菌的逆境耐受性. 黄小鸣,童钰,马君妍,祝凯丽,周杨武,陆海霞,励建荣. 2014

[20]白砂枇杷抗逆优质生产技术研究. 王引,何理坤,陈方永,倪海枝,王冬米,邱智敏,任正初. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序