百合斑驳病毒靖宇分离物全基因组序列测定与进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张春雨

作者： 张春雨;李小宇;王晨;黄瑞贤;黄淑敏;王永志

作者机构： 吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)植物保护研究所;靖宇县农业技术推广中心

关键词： 百合斑驳病毒;基因组

期刊名称： 北方园艺

ISSN：

年卷期： 2023 年 024 期

页码： 59-64

收录情况： 北大核心

摘要： 以采自吉林省白山市靖宇县的野生百合感病叶片为试材，采用小RNA深度测序法检测到1株百合斑驳病毒（Lily mottle virus,LMoV）,采用分段克隆方法，对LMoV靖宇分离物（LMoV-JY）的全基因组进行测定并分析，以期对吉林省百合病毒病的检测和防控提供参考依据。结果表明：LMoV-JY基因组大小为9 648个核苷酸（nt）序列（GenBank登录号MT795719）,该核苷酸序列在第154～9 444位存在1个大的开放阅读框（ORF）,编码1个多聚蛋白（分子量351.46 kD）。LMoV-JY与GenBank中登录的其他LMoV分离物的全基因组核苷酸序列比较，其一致性为82.82%～97.85%,在氨基酸水平上的一致性为92.96%～98.64%,其中与百合斑驳病毒大连分离物LMoV-DL（HM222521）的一致性在该2种水平上均为最高。对比LMoV-JY外壳蛋白与其他54个分离物的氨基酸序列，发现可将LMoV分离物分为2个类群。

分类号： S436.8

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