甘蓝型油菜恢复系的群体结构解析及核心种质构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张格格

作者： 张格格;柳海东;杜德志

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;春油菜;全基因组重测序;群体结构;核心种质

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 231-239

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为加快选育适应春油菜区的强优势杂交种，解析甘蓝型油菜恢复系的群体结构及构建核心种质，利用全基因组重测序技术对144份恢复系组成的群体进行全基因组扫描，利用3 881 462个SNP标记，计算材料间的遗传距离，确定最优分群数，评估连锁不平衡程度，采用分层取样的方法，结合等位基因数目最大化策略，构建核心种质。结果表明，基于遗传距离和群体结构两种方法，可将群体划分为7类。整个群体中连锁不平衡程度较低。利用CoreHunter软件构建了C30和C40两个较优核心子集，C30包括44份种质资源，C40包括59份。通过评价，核心种质等位基因覆盖度均达到99%，多态信息含量达到0.24,C30和C40这两个核心子集均能代表144份甘蓝型油菜原始种质，其中C30可确定为最终的核心子集，用于亲本杂优分析。

分类号： S565.4

  • 相关文献

[1]基于全基因组重测序对7个牦牛类群的群体结构分析. 王佟,马晓明,李婧,潘和平,仁青吉,梁春年,阎萍. 2023

[2]基于全基因组重测序对祁连白藏羊类群的群体结构分析. 余道宁,王佟,铁中华,秦玉峰,喇永富,马晓明,张德荣,扎西塔,梁春年. 2023

[3]特早花甘蓝型油菜的开花特征及特早花候选基因鉴定. 余华胜,张冬青,陈佳麒,张尧锋,傅鹰. 2021

[4]辣椒核心种质遗传多样性及群体结构分析. 袁欣捷,周坤华,吴茵,方荣,陈学军. 2019

[5]老芒麦遗传多样性分析及核心种质构建. 闫伟红,马玉宝,张晶然,王凯,孟庆伟. 2016

[6]中国和国际豌豆核心种质群体结构与遗传多样性差异分析. 宗绪晓,关建平,顾竟,王海飞,马钰. 2009

[7]罗汉果遗传多样性与群体结构及核心种质研究. 莫长明,谢文娟,郭文锋,张燕玲,黄江,张馨丹,李忠,唐其,马小军. 2023

[8]老芒麦遗传多样性分析及核心种质构建. 闫伟红,马玉宝,张晶然,王凯,孟庆伟. 2017

[9]青稞种质资源遗传多样性分析与核心种质群体的构建. 原红军,曾兴权,徐其君,王玉林,扎桑,尼玛扎西. 2018

[10]黍稷高基元EST-SSR标记开发及200份核心种质资源遗传多样性分析. 王倩,张立媛,许月,李海,刘少雄,薛亚鹏,陆平,王瑞云,刘敏轩. 2023

[11]甘蓝型油菜2009-2010年候选品种遗传多样性及群体结构. 许鲲,谷铁城,刘凤兰,李浩,陈碧云,高桂珍,伍晓明. 2012

[12]基于SLAF-seq技术构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质. 赵绪涛,柳海东,李开祥,贾永鹏,杜德志. 2019

[13]特早熟甘蓝型春油菜恢复系核心种质构建. 林晓阳,杜德志,柳海东,李钧. 2022

[14]甘蓝型油菜一个代表性核心种质的遴选. 任丽平,倪西源,黄吉祥,雷伟侠,曹明富. 2008

[15]基于重测序的籽粒型和鲜食型大豆的全基因组变异分析. 郭丹丹,袁凤杰,郁晓敏. 2019

[16]利用重测序InDel位点开发甜椒隐性核不育分子标记. 孟雅宁,严立斌,田玉,范妍芹. 2019

[17]韩国赤芝全基因组重测序分析. 朱风丽,徐晓兰,陈体强,石林春,缪晓青,兰进. 2019

[18]马早期流产相关功能基因挖掘的研究. 吴海青,刘威,马跃军,苏少锋,萨初拉,付绍印,高文渊,李玉荣. 2021

[19]全基因组重测序在大豆育种上的研究进展. 赵海红,郭泰,王志新,郑伟,李灿东,徐杰飞,张振宇,赵星棋,王士强. 2020

[20]水稻特大穗恢复系R1126株叶型性状遗传基础剖析. 孙平勇,舒服,何强,邓华凤. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序