甘蔗、斑茅及割手密Ⅲ型过氧化物酶基因克隆及比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡小文

作者： 胡小文;姚艳丽;邢淑莲;徐磊;刘洋

作者机构： 中国热带农业科学院湛江实验站

关键词： 甘蔗;割手密;斑茅;Ⅲ型过氧化物;基因克隆

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 10 期

页码： 2340-2347

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 研究旨在通过比较分析甘蔗及其近缘种割手密和斑茅Ⅲ型过氧化物酶(Prxs)基因差异,探讨这三种植物Prxs功能差异的遗传基础。采用同源克隆方法,成功克隆获得了甘蔗、斑茅和割手密的Prxs基因DNA序列(Genebank登录号分别为KJ001797,KJ001798和KJ001799)。经测序鉴定,克隆获得的这三个基因DNA长度分别为3 030 bp、3 048 bp和3 028 bp,外显子长度均为1 083 bp,其中编码区长度为996 bp,编码331个氨基酸。蛋白质保守结构域分析表明,此三个基因均具有过氧化物酶典型保守结构域,属于依赖于亚铁血红素Ⅲ型过氧化物酶亚类,为目标基因,且在功能位点区域高度保守,只存在一个氨基酸位点差异。基因结构比较分析表明,克隆获得的割手密、斑茅和甘蔗过氧化物酶基因均包含4个外显子,与高粱、玉米和水稻的同源基因外显子个数一致,外显子长度有较小差异,而内含子长度却存在较大差异。高粱、玉米和水稻Prxs同源基因均处在靠近染色体末端的位置,说明此基因存在一定的同线性。本研究结果为深入研究Prxs基因在不同植物中功能差异提供了一定的参考,为研究植物中Prxs基因的进化规律奠定了一定的基础。

分类号： S566.1

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