建兰'锦旗'叶片转录组分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 曾艳华

作者: 曾艳华;龙蔷宇;何荆洲;李秀玲;范继征;卜朝阳

作者机构:

关键词: 建兰;叶色调控;转录组;差异表达基因

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 012 期

页码: 3867-3877

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 建兰‘锦旗’(Cymbidium ensifolium’Jinqi’)为大金边叶艺传统品种,因其易花易植,观赏价值高而倍受人们喜爱。为了解建兰‘锦旗’叶艺中差异表达基因及分子调控途径,本研究对建兰‘锦旗’叶片绿叶部位和黄叶部位进行转录组测序和分析,共获得单基因簇(Unigenes) 32 393条,总长度为33 848 710 bp,平均长度为1 044.94 bp。通过与蛋白数据库的比对,18 063条Unigenes可获得注释信息。基因本体(gene ontology, GO)分析发现,共注释到49个功能组,其中代谢过程和细胞过程(生物学过程)、催化活性(分子功能)以及膜(细胞组分)的富集程度较高。KEGG分析结果表明差异表达基因主要参与光合作用等生物学过程的调节,共筛选出32条差异基因富集的代谢通路,58个差异表达转录因子。进一步筛选差异表达显著的20个转录因子,分析发现,其中上调表达15个,下调表达5个,主要经光合作用过程、黄酮类生物合成、卟啉和叶绿素代谢等机制介导建兰‘锦旗’叶色调控,提示其在建兰‘锦旗’叶艺进化中可能发挥重要的作用。本研究结果为探究建兰叶艺进化的分子机制研究提供参考。

分类号: S682.31

  • 相关文献

[1]基于高通量测序的建兰转录组信息分析. 樊荣辉,林兵,吴建设,钟淮钦. 2023

[2]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018

[3]感染球孢白僵菌的家蚕免疫应答差异表达基因分析. 侯成香,覃光星,耿涛,高坤,潘中华,钱荷英,郭锡杰. 2014

[4]福清山羊和戴云山羊夏季发情期卵巢组织比较转录组分析. 吴贤锋,李文杨,刘远,张莹,黄勤楼. 2019

[5]外源赤霉素诱导矮生山茶恨天高植株生长的转录组分析. 王江英,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,葛金涛,赵统利,李纪元,惠林冲,邵小斌. 2020

[6]玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析. 练冬梅,赖正锋,姚运法,张少平,林碧珍,洪建基. 2020

[7]美国红枫叶片转录组分析. 郭聪,王莹,谈峰,陈燕,李玉娟. 2020

[8]感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析. 刘玉娣,王香萍,侯茂林. 2018

[9]马铃薯萌芽出苗期根系对水分胁迫的响应机理分析. 王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞. 2019

[10]福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析. 刘远,李文杨,吴贤锋,黄勤楼,高承芳,陈鑫珠,张晓佩. 2019

[11]红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释. 吴亚维,徐娟,韩秀梅,张兴无,洪怡,文晓鹏. 2019

[12]硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析. 姚运法,练冬梅,林碧珍,赖正锋,洪建基. 2021

[13]亚麻响应低钾胁迫转录谱分析. 黄文功,姜卫东,姚玉波,宋喜霞,刘岩,陈思,赵东升,吴广文,袁红梅,任传英,孙中义,吴建忠,康庆华. 2021

[14]低温胁迫对冰菜转录组水平响应分析. 赖正锋,姚运法,林碧珍,练冬梅,洪建基. 2021

[15]卡尼鄂拉蜂越冬工蜂咽下腺转录组学分析. 范荣莉,王康,蔺哲广,张文文,刘振国,梁勤,陈国宏,吉挺. 2020

[16]植物响应干旱的转录组学研究进展. 倪知游,梁东,高帆,胡容平,夏惠. 2018

[17]花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析. 姚玉荣,霍建飞,郝永娟,贲海燕,王万立. 2020

[18]基于RNA-Seq分析褪黑激素对绒山羊皮肤基因表达的影响. 丽春,付绍印,王建蒙,王位. 2018

[19]低温诱导稻曲病菌菌核形成的转录组学分析. 吕楚阳,邓平川,张晓丽,孙钰超,梁五生,胡东维. 2020

[20]黄秋葵对南方根结线虫抗性的转录组分析. 练冬梅,赖正锋,姚运法,林碧珍,洪建基. 2020

作者其他论文 更多>>