大菱鲆MKK基因家族全基因组鉴定及其在生物和非生物应激下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郑卫卫

作者： 郑卫卫;徐锡文;陈松林;俄泽琛;刘英杰

作者机构：

关键词： 大菱鲆;丝裂原活化蛋白激酶激酶(MKK);基因家族;生物应激;非生物应激

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2023 年 47 卷 001 期

页码： 123-135

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了阐明大菱鲆丝裂原活化蛋白激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinases,MAPKKs或MKKs)基因家族在生物和非生物应激响应中的作用,本实验首先通过生物信息学方法对大菱鲆MKK基因家族进行了全基因组水平的鉴定,利用多个应激相关转录组数据集分析了大菱鲆MKK家族成员在不同组织及不同生物和非生物应激下的表达模式.结果显示,本研究在大菱鲆全基因组水平上共鉴定出9个MKK基因家族成员,它们不均匀地分布在7条染色体上,并分别对其编码蛋白的理化性质、蛋白二级结构和亚细胞定位进行了预测.基于系统发育分析,将SmMKKs划分为5个亚家族.内含-外显子结构、保守基序和多重序列比对分析结果不仅为大菱鲆MKK亚家族分类提供了证据,而且表明SmMKKs在进化上高度保守.SmMKKs在不同组织及不同生物和非生物应激下的基因表达模式分析表明,SmMKKs具有明显的组织特异性表达.另外,结果显示,粘孢子虫和肿大细胞病毒感染后,SmMKK6a呈极显著差异表达;热应激处理后,SmMKK6a呈极显著差异表达;高盐或低盐胁迫后,SmMKK4a、SmMKK4b、SmMKK6a和SmMKK7呈极显著差异表达.SmMKK6a在各种应激条件下均表现出极显著响应,表明其可能在综合抗应激中具有潜在的作用.这可能是第一个对大菱鲆MKK基因家族进行系统识别和功能分析的研究.以上研究结果不仅表明MKK基因家族在大菱鲆响应多种生物和非生物应激中发挥重要作用,而且也为大菱鲆综合抗逆分子选择育种研究提供了重要的理论支撑.

分类号： Q785%S917.4

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