飞行时间质谱法检测水牛黑素皮质素受体4基因多态性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邓廷贤

作者： 邓廷贤;庞春英;朱鹏;段安琴;陆杏蓉;杨炳壮;梁贤威

作者机构：

关键词： 水牛;飞行时间质谱;黑素皮质素受体4基因;SNPs

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2015 年 42 卷 07 期

页码： 1800-1806

收录情况： 北大核心

摘要： 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测水牛黑素皮质素受体4(MC4R)基因的多态性(SNPs),为今后建立水牛辅助标记选择策略奠定基础。以水牛MC4R基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了水牛MC4R基因13个SNPs。为进一步验证筛选的可靠性,应用MALDI-TOF-MS针对380头水牛检测了8个标记的基因型。结果显示,平均检出率为98.0%,能够准确的检测出3种常见的基因型。所检SNP位点的平均最小等位基因频率(MAF)为0.24,平均杂合度为0.28,平均多态信息含量(PIC)为0.23。本研究建立的基于PCR测序法联合MALDI-TOF-MS检测水牛MC4R基因多态性的方法,具有快速、可靠和准确的特点,为今后开展水牛生产性状基因的SNP分型和检测等研究奠定了基础。

分类号： S823

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