猪嵴病毒VP0基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈如敬

作者： 陈如敬;修金生;陈晓珞;吴学敏;车勇良;王晨燕;严山;王隆柏;周伦江

作者机构：

关键词： 猪嵴病毒;VP0基因;克隆;序列分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2015 年 42 卷 09 期

页码： 2303-2307

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究根据猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)VP0基因序列特征设计特异性扩增引物,采用RT-PCR方法扩增猪嵴病毒VP0基因全长编码区。将特异性扩增目的片段克隆后进行序列测定,将结果进行拼接后获得猪嵴病毒VP0基因全长并进行相关生物信息学分析。所扩增的目的片段编码有完整的VP0基因开放阅读框,全长为1 098bp,编码有366个氨基酸,理论等电点为6.71,理论分子质量为38.489ku,不稳定系数为34.65,最大疏水指数为2.622,最小疏水指数为-2.122。将获得的VP0基因和GenBank中的猪嵴病毒代表株VP0基因序列进行核苷酸同源性比对和遗传进化分析,其与HNXX-4核苷酸同源性最高,为89.1%,与S-1-HUN核苷酸同源性最低,为81.1%。从遗传进化上看,猪嵴病毒VP0基因在遗传进化上呈两个独立的基因亚群,猪嵴病毒中国分离株在两个遗传基因亚群上均有分布。

分类号： S852.65

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