山西草莓斑驳病毒cp基因克隆及遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈伟

作者： 陈伟;李志卫;玉山江·麦麦提;聂园军;李亚娟;赫娟;柴敏;罗永平

作者机构：

关键词： 草莓斑驳病毒;cp基因;遗传多样性

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2023 年 32 卷 012 期

页码： 2007-2013

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性.从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.10软件分析cp基因的遗传多样性,采用RDP v.4.31软件检测SMoV中的重组事件.RT-PCR检测后发现,从山西省各地区收集的159份草莓叶片中有65份样品呈阳性,检出率为38.46%.这些阳性样品经过分离、测序、克隆,获得16个SMoV分离物.结合在线的19个SMoV分离物系统进化树分析显示,35个SMoV分离物被分成两组,组1包含28个分离物,均来自中国;组2包含7个分离物,分别来自加拿大、日本和美国.经选择压分析和中性检验,组1和组2 SMoV分离物之间存在显著的遗传差异,且中性检验均为负值,SMoV种群呈扩张状态.序列相似性分析表明,35株分离物的核苷酸同一性为81.34%~100%,氨基酸的一致性为94.77%~100%,呈现出较高的相似性.可见:SMoV存在较高的遗传变异,负选择压力可能是导致SMoV遗传多样性的原因.

分类号： S436.68

  • 相关文献

[1]辽西李属坏死环斑病毒检测及其多样性分析. 李正男,董雅凤,张双纳,张尊平,范旭东,任芳,胡国君. 2016

[2]云南烟草产区辣椒脉斑驳病毒的调查及其遗传多样性分析. 陈越,韩天华,马文广,钟静,尹跃艳,赵丽玲,李婷婷,丁铭. 2024

[3]无花果病毒CP基因克隆及遗传多样性分析. 陈伟,薛婷,李亚娟,王瑞鑫,玉山江·麦麦提. 2023

[4]贵州黔西南烟草中辣椒脉斑驳病毒的鉴定及遗传多样性分析. 陈越,朱迪,李婷婷,钟静,高贵,穆青,曹毅,丁铭. 2023

[5]辽西李属坏死环斑病毒检测及其多样性分析. 李正男,董雅凤,张双纳,张尊平,范旭东,任芳,胡国君. 2017

[6]上海两个草莓病毒病的症状与病毒粒子形态观察. 杨式琅,舒维三,童尧明,华德明,赵建华,沈德珍. 1988

[7]陕西省草莓病毒种类的LncRNA测序初步鉴定. 黄倩茹,牛永浩,吴宽,刘占杰,曹孟籍,赵磊,吴云锋. 2021

[8]马铃薯Y病毒CP基因RNAi载体构建与干涉效果测定. 李奇科,陶刚,邱又彬,邱礽,迟胜起,朱英,刘作易. 2009

[9]蚜虫中携带马铃薯卷叶病毒检测方法的改进. 韩树鑫,白艳菊,张威,高艳玲,范国权,张抒,申宇. 2016

[10]滇黑两省黄瓜花叶病毒南瓜分离物外壳蛋白基因序列分析. 杨国慧,张仲凯,崔崇士. 2006

[11]黄瓜花叶病毒贵州辣椒分离物外壳蛋白基因序列分析. 付尚松,王莉爽,杨学辉,蒋选利. 2020

[12]苹果茎沟病毒梨分离物外壳蛋白基因的克隆和序列分析. 郑银英,洪霓,王国平,胡红菊. 2006

[13]青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析. 程亮. 2019

[14]转基因花生外源基因田间漂移风险初步研究. 陈坤荣,许泽永,晏立英,方小平. 2009

[15]河北省藁城花生病毒病的 RT-PCR 检测及外壳蛋白基因序列分析. 康彦平,晏立英,雷永,廖伯寿. 2015

[16]马铃薯卷叶病毒缺失突变CP基因的原核表达及抗血清的制备. 隋炯明,何心凤,郭真,李广存,王晶珊,郭宝太. 2012

[17]合肥地区发生的西瓜花叶病的病原鉴定. 李世访,范卫红,成卓敏,王杰. 2004

[18]江苏省葫芦科作物西瓜花叶病毒的分子鉴定和序列分析. 任春梅,程兆榜,缪倩,魏利辉,周益军,范永坚. 2013

[19]贵州辣椒叶脉黄化病毒分离物检测及其P0、CP、MP基因进化分析. 王莉爽,李淳,杨学辉,张松柏,刘勇. 2020

[20]苹果茎痘病毒PCR检测及分子变异分析(摘要). 李丽丽,董雅凤,张志宏,张尊平,裴光前. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序