绵羊尾脂沉积关键基因筛选及lncRNA-miRNA-mRNA调控网络分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张羽欣

作者： 张羽欣;张龙;郭妍岩;石笑迪;李博禹;阮维斌;姚大为;张效生

作者机构：

关键词： 杜泊羊;天津大尾羊;尾脂;RNA-seq;ceRNA

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2025 年 40 卷 003 期

页码： 190-198

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选不同尾型绵羊尾部脂肪组织之间的差异表达mRNAs、miRNAs和lncRNAs,构建参与调控绵羊尾部脂肪沉积的重要竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络，随机选取2岁(24月龄)杜泊羊和天津大尾羊各3只，取尾部脂肪组织进行H&E染色和全转录组测序，运用生物信息学筛选差异表达的RNAs,并进行靶基因预测和功能富集，从调控脂质沉积的角度，进一步分析其调控网络和靶向关系。结果表明，天津大尾羊尾部脂肪细胞面积显著大于杜泊羊尾部脂肪细胞；杜泊羊和天津大尾羊尾部脂肪组织存在差异表达的mRNAs共有1 156个(403个上调表达，753个下调表达),差异表达的miRNAs共有72个(其中46个上调表达，26个下调表达),差异表达的lncRNAs共392个(142个上调表达，250个下调表达);同时，差异表达lncRNAs预测到靶基因216个，这些靶基因参与四氢叶酸代谢过程、GAIT复合体、辅酶分解代谢过程等与脂代谢相关生物学过程以及甘油酯代谢、生物素代谢、脂肪消化和吸收及磷脂酰肌醇信号系统等信号通路；通过预测差异表达的mRNAs和lncRNAs与miRNAs的靶向关系，成功构建一个与绵羊尾脂沉积密切相关的ceRNA网络，其中24个lncRNAs和6个miRNAs被预测可以调控PROX1、LPL及LRP1B与脂代谢密切相关的基因。综上，PROX1、LPL和LRP1B在绵羊尾脂沉积中发挥关键作用，预测到MSTRG.9916.7等4个lncRNAs通过PROX1正向调节脂肪代谢，MSTRG.7563.1和MSTRG.4729.1通过LPL正向调节脂肪代谢。

分类号： S826

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