利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘佳

作者： 刘佳;张梦雅;任世龙;王永芳;马继芳;全建章;刘磊;董志平;白辉;李志勇

作者机构：

关键词： 谷子;谷瘟病菌;SRAP;相似性系数;遗传多样性

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 179-187

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 了解谷瘟病菌的变异和群体结构，为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增，利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析，通过UPGMA方法进行聚类分析，使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明，筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析，这8对引物共扩增出条带1 728条，其中多态性条带1 492条，多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析，其相似性系数为0.77～0.85,遗传相似系数为0.802时，所有菌株被分为27个遗传宗谱（L1～L27）,其中L1为绝对优势组群，共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌，占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析，9个地区谷瘟病菌的Nei′s遗传多样性指数（H）为0.141 4～0.288 1,Shannon′s信息指数（I）为0.196 0～0.441 6,河北夏谷区Nei′s遗传多样性指数和Shannon′s信息指数最高，遗传多样性最丰富，而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较，吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远，而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见，不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富，各菌株间存在遗传分化，但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。

分类号： S435.15

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