荔枝HSP70家族鉴定及其响应非生物胁迫的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 凡超

作者： 凡超;杨杰;陈蓉;刘伟;向旭

作者机构：

关键词： 荔枝;HSP70基因家族;生物信息学;表达分析

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 1102-1119

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： HSP70蛋白作为热激蛋白（heat shock protein,HSP）家族重要成员之一，在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥着重要作用。为探究荔枝（Litchi chinensis） HSP70基因家族成员在应对低温、高温、干旱及盐胁迫环境时的作用，利用生物信息学方法鉴定荔枝全基因组中的HSP70基因家族，并通过实时荧光定量PCR （quantitative real-time PCR, q RT-PCR）技术检测HSP70家族成员在不同非生物胁迫处理下的表达模式。结果显示，Lc HSP70基因家族共包含18个成员，不均匀地分布在荔枝的10条染色体上，其蛋白包含479-851个不等的氨基酸，等电点介于5.07-6.95之间，分子质量为52.44-94.07 k Da。Lc HSP70蛋白在细胞核、细胞质、内质网、线粒体和叶绿体中有分布。系统进化分析发现Lc HSP70蛋白分布在5个亚族，分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅵ亚族。Lc HSP70s启动子区域拥有多种与植物生长发育、激素响应及逆境响应相关的顺式作用元件。转录组数据分析显示，Lc HSP70s存在明显的组织表达特异性，总体上可分为普遍性表达和特异性表达。非生物胁迫表达分析显示，该基因家族成员均可以对低温、高温、干旱和盐胁迫作出不同程度的反应，且在不同时间表达差异显著。上述研究结果为进一步探究荔枝HSP70基因家族的功能奠定了基础。

分类号： S667.1%Q943.2

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