海南岛越南油茶种质CdS-RNase基因及其编码蛋白的多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任家乐

作者： 任家乐;郑道君;姚雨彤;刘祖琪;孙秀秀;王春梅;申帅帅;陈业光;戚华沙;陈加利;梁恒;陈健妙;夏腾飞

作者机构：

关键词： 海南岛;越南油茶;自交不亲和;CdS-RNase基因;CdS-RNase蛋白;多样性分析

期刊名称： 中南林业科技大学学报

ISSN： 1673-923X

年卷期： 2024 年 44 卷 011 期

页码： 133-145

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]为了分析海南岛本地越南油茶种质中CdS-RNase基因及其编码蛋白的多样性,探索CdS-RNase蛋白类型与越南油茶自交坐果率之间的关系,为依据CdS-RNase蛋白类型合理搭配越南油茶田间种质和提高越南油茶坐果率,提供科学参考.[方法]选取60 份海南岛本地越南油茶种质,以其花柱cDNA为模板,RT-RCR特异扩增CdS-RNase基因序列.琼脂糖凝胶电泳检测和切胶回收CdS-RNase基因特异性扩增条带,并把特异性扩增条带连接到平末端测序载体上.将测序载体转化到大肠杆菌感受态细胞中,用带有卡那霉素抗性的LB固体培养基筛选阳性单克隆,测序得到CdS-RNase基因序列.随后,60份越南油茶种质与"CV1"~"CV18"的CdS-RNase基因序列一起用于基因单体型划分、单体型聚类分析、获得CdS-RNase蛋白氨基酸序列、CdS-RNase蛋白分型、CdS-RNase蛋白二级结构预测等.最后,根据越南油茶种质中CdS-RNase蛋白类型,把越南油茶种质划分为三类:类型I,只检测到正常CdS-RNase蛋白;类型II,同时检测到正常CdS-RNase和突变CdSm-RNase蛋白;类型III,只检测到CdSm-RNase蛋白.每类越南油茶种质挑选5份,开展自交坐果率统计试验.[结果]78 份海南岛本地越南油茶种质中共鉴定到 171 个CdS-RNase基因单体型(Hap1~Hap171),编码 35种正常CdS-RNase蛋白(CdS1-RNase~CdS35-RNase)和 22 种突变CdSm-RNase蛋白(CdSm1-RNase~CdSm22-RNase).正常CdS-RNase蛋白和突变CdSm-RNase蛋白二级结构中α-螺旋比例差异不显著,但是突变CdSm-RNase蛋白二级结构中β-转角和β-折叠的比例极显著或显著高于正常CdS-RNase蛋白,无规则卷曲比例显著低于正常CdS-RNase蛋白.类型I越南油茶种质自交坐果率显著低于类型II,类型II越南油茶种质自交坐果率显著低于类型III.[结论]海南岛本地越南油茶种质CdS-RNase基因及其编码蛋白多样性丰富,突变CdSm-RNase蛋白可能通过增加其二级结构中β-转角和β-折叠的比例减少无规则卷曲比例影响其蛋白功能的发挥,突变CdSm-RNase蛋白能一定程度上提高越南油茶自交坐果率.

分类号： S794.4

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