杭州地区甘蔗花叶病毒病原鉴定

文献类型: 中文期刊

第一作者: 蒋军喜

作者: 蒋军喜;周雪平

作者机构:

关键词: 杭州地区;甘蔗;花叶病毒;病原鉴定;高粱;免疫捕获反转录PCR

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2002 年 010 卷 004 期

页码: 377-380

摘要: 从杭州田间表现典型花叶症的甘蔗病叶中得到病毒分离物SC-ZJ,按照SCMV亚组中甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV),玉米矮花叶病毒(Maize dwarf mosaic virus,MDMV)、高粱花叶病毒(Sorghum mosaic virus,SrMV)、约翰逊草花叶病毒(Johnsongrass mosaic virus,JGMV)等4种病毒基因组序列设计特性引物,对SC-ZJ进行IC-RT-PCR扩增,结果用SrMV特异性引物扩增到1条长约1.1kb的片段,而用其它3种病毒特异性引物扩增不出任何片段.扩增片段经克隆后测定序列,序列包含1135核苷酸(nt),编码378个氨基酸(aa),取其中的近全长外壳蛋白(CP)氨基酸序列(312aa),与SrMV、MDMV,SCMV,JGMV等4种病毒对应的序列进行同源性比较,结果核苷酸序列同源性依次为95.3%、75.2%、61.2%和53.6%,氨基酸序列同源性依次为97.1%、78.1%、72.9%和56.2%,根据IC-RT-PCR扩增鉴定及序列同源性比较结果,将SC-ZJ鉴定为SrMV.并根据CP氨基酸序列的同源性进一步分析了4种病毒的亲缘关系.

分类号: S435.661%S43

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