花生RGA-SSCP实验条件的优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 漆燕

作者： 漆燕;李双铃;袁美;王辉;任艳;石延茂;崔富华;李加纳;禹山林

作者机构：

关键词： 花生;RGA-SSCP;优化;分子标记

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2010 年 06 期

页码： 1-4+9

摘要： 单链构象多态性(SSCP)技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,近年在植物研究中得到了较多应用。为了检测花生品种间抗病基因同源序列(RGA)的单核苷酸差异,对影响花生RGA-SSCP的电泳温度、电压、胶浓度、交联度、变性剂等因素进行了优化。结果表明,碱变性后的PCR产物(PCR产物与碱变性剂比例1∶2)在不加甘油的8%非变性聚丙烯酰胺凝胶(交联度为29∶1)、1×TBE电泳缓冲液、恒温4℃和600V条件下电泳5 h为最佳优化组合。用上述优化方法分析了抗、感北方根结线虫病的亲本及F2群体部分单株,获得了电泳条带细而清晰的SSCP图。该体系的建立对RGA-SSCP标记用于花生基因定位、遗传图谱构建、标记辅助选择等具有重要意义。

分类号： S565.2

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