美丽硬仆骨舌鱼全基因组微卫星分布规律特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 段永楠

作者： 段永楠;刘奕;胡隐昌;刘超;宋红梅;汪学杰;孙金辉;牟希东

作者机构：

关键词： 美丽硬仆骨舌鱼;全基因组;微卫星;碱基含量;分布规律

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2019 年 23 期

页码： 152-158

摘要： 本研究旨在了解美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)基因组微卫星分布规律。采用生物信息学方法对国际濒危物种美丽硬仆骨舌鱼全基因组范围内的微卫星数量及分布规律进行了分析。结果显示:1～6个微卫星重复类型的微卫星序列354239个,总长度为6139487 bp。微卫星单碱基、二碱基、三碱基、四碱基和五碱基重复单元中数量最多的分别为A、AC、AAT、ATCC、AAAAT。25条染色体中,6号染色体所含微卫星数目最多(28662个),22号染色体所含微卫星数目最少(6929个),微卫星数量与其所在染色体DNA序列长度呈线性相关(r=0.999)。22号染色体微卫星出现频率最高(576.35个/Mb),3号染色体微卫星出现的频率最低(469.65个/Mb),结果显示,微卫星频率与其所在染色体DNA序列长度并不相关。本研究为进一步通过微卫星分子标记开展美丽硬仆骨舌鱼亲缘关系鉴定和遗传多样性分析、微卫星标记在硬仆骨舌鱼科的通用性分析奠定了基础。

分类号： S917.4

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