基于高通量测序和传统分离研究雪茄外包皮表面细菌多样性及演替

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张鸽

作者： 张鸽;梁开朝;辛玉华;王娟;李书贵;李爱军;王帆;张海波;刘好宝

作者机构：

关键词： 雪茄外包皮;高通量测序;发酵时期;细菌多样性;群落演替

期刊名称： 应用与环境生物学报

ISSN： 1006-687X

年卷期： 2018 年 004 期

页码： 783-788

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 细菌在烟叶发酵过程中起着重要作用,为探索烟叶的发酵机理,采用Illumina miseq高通量测序技术(Highthroughput sequencing,HTS)和传统微生物分离方法,对墨西哥不同发酵时期雪茄外包皮表面细菌群落结构、丰富度及演替进行研究.(1)HTS获得有效序列条数514 641条,包含65个OTUs,主要种属为棒状杆菌属(Corynebacterium)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)等.HTS结果表明,墨西哥雪茄外包皮表面细菌群落组成丰富,细菌群落结构随发酵进程而变化,优势微生物由棒状杆菌属(44.64%)和假单胞菌属(40.88%)演替为后期的葡萄球菌属(72.78%).α多样性结果表明FJQY-1和FJQY-2样品的细菌群落具有较高的丰富度.β多样性分析发现FJQY-2、FJQY-3和FJQY-4三个样品细菌结构及丰度较为相似.(2)传统分离结果显示,不同发酵时期雪茄外包皮表面细菌主要为芽孢杆菌属(55.10%)和葡萄球菌属(22.45%),与HTS结果比较,单一传统分离方法不能全面反映不同时期雪茄外包皮表面细菌群落结构和演替.本研究表明,在不同发酵时期,雪茄外包皮表面细菌发生着群落演替;HTS测序在揭示微生物群落演替中发挥了重要作用;传统微生物分离鉴定方法不能全面反映微生物多样性及群落演替,但能获得发酵过程中的部分微生物用于后期功能研究.

分类号： TS453

  • 相关文献

[1]不同养殖年份鱼塘底泥细菌群落多样性及演替分析. 唐凌,邝声耀,刘兴国,张纯,张锦秀. 2014

[2]基于高通量测序探究东北粳稻储藏期间真菌群落的演替. 李欣蔚. 2022

[3]胜利油田油泥沙细菌和古菌多样性研究. 方绍燕,张辉. 2014

[4]微生物发酵床不同深度垫料的细菌群落多样性. 陈倩倩,刘波,朱育菁,刘国红,车建美,王阶平,郑雪芳,张海峰. 2019

[5]添加辣椒对酸鱼发酵进程和理化指标的影响. 夏秀东,单成俊,刘小莉,吴寒,王英,张丽霞,黄自苏,周剑忠. 2018

[6]塔克拉玛干沙尘暴源区空气细菌群落多样性. 王丹丹,林青,欧提库尔·玛合木提,杨红梅,娄恺. 2018

[7]基于高通量测序技术的铬污染农田土壤菌群多样性及修复菌株的筛选. 肖蓉,王媛,聂园军,程滨,赵佳,曹秋芬. 2019

[8]茶园间作灵芝对土壤细菌多样性和群落结构的影响. 李艳春,林忠宁,陆烝,刘明香. 2019

[9]基于16S rDNA高通量测序的玉米根际与非根际土壤细菌多样性比较. 徐丽霞,何永吉. 2019

[10]地膜对植椒土壤生物学特性和细菌多样性的影响. 刘岳飞,吴人敏,张传进,姚华开,杨尚东. 2019

[11]长期施用沼液对槟榔芋土壤细菌群落结构和多样性的影响. 刘兰英,黄薇,李莹,吕新,陈丽华,李玥仁. 2022

[12]盐渍藠头盐水细菌多样性及基因功能预测分析. 葛东颖,仇港,赵楠,赵慧君,郭壮. 2020

[13]转IGF-1基因超细毛羊与非转基因羊肠道粪便菌群多样性及组成差异分析. 王新华,张星星,王立民,黄新,韩猛立,张译元,郭延华,唐红,何延华,钟发刚,周平. 2020

[14]袋料种植淮山药根际土壤细菌多样性的高通量测序分析. 劳承英,韦本辉,周灵芝,申章佑,李艳英,胡泊,黄渝岚,周佳. 2020

[15]基于高通量测序技术对三种太岁样品细菌组成的分析. 王朝江,王世清. 2017

[16]基于宏基因组方法分析养猪发酵床微生物组季节性变化. 陈倩倩,刘波,王阶平,朱育菁,张海峰. 2018

[17]不同再生水灌溉方式对土壤-辣椒系统中细菌群落多样性及病原菌丰度的影响. 崔丙健,高峰,胡超,李中阳,樊向阳,崔二苹. 2019

[18]新疆哈萨克族传统风干肉中细菌多样性分析及安全评价. 王俊钢,李宇辉,刘成江,王刚,蒲顺昌. 2021

[19]施用木醋液甜瓜根系生长及根际土壤生物学性状与细菌多样性变化. 张传进,吴人敏,王帅帅,周柳强,杨尚东,谭宏伟. 2019

[20]传统鱼露发酵过程中细菌群落演替及对其挥发性风味形成的影响分析. 李春生,王悦齐,李来好,陈胜军,吴燕燕,胡晓,荣辉. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序