非洲水稻种质资源SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄瑞
作者: 黄瑞;周雷;何卫;李三和;陈志军;刘凯;闸雯俊;杨国才;焦春海;游艾青
作者机构:
关键词: 种质资源;指纹图谱;遗传多样性分析;非洲
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2015 年 13 卷 07 期
页码: 1476-1486
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究利用均匀分布于水稻12条染色体上的36对SSR引物,以57份来自非洲和5份国内生产上的骨干品种为试验材料,进行遗传多样性分析和SSR指纹图谱的构建。结果表明:36对引物在供试材料中都具有多态性片段,共检测到192个等位基因,平均每位点5.3个等位基因;每个标记的多态性信息含量(PIC)为0.181~0.823,平均值为0.570,从中筛选出在供试材料中多态性好、扩增稳定、杂带少且PIC比较高的18个引物为核心标记构建指纹图谱。采用非加权类平均法进行聚类分析,结果显示:62个品种在相似系数0.66处分为籼、粳两亚种类群;聚类树形图也能比较好地划分品种的地理来源。以等位位点的纯合性为指标,54个品种具有稳定的遗传基础。研究结果有助于优异水稻资源的创新利用,辅助杂交育种中的亲本选配,扩大栽培稻遗传基础进而提高产量、改良品质和抗性。
分类号: S511
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