牛多个组织microRNASolexa测序与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘飞

作者: 刘飞;杨继业;孙志颖;胡鑫;李娟;孔令娜;梁瑞圆;宋振宇;张路培;陈燕;高雪;李俊雅;孙少华

作者机构:

关键词: 牛;多组织;microRNA;高通量测序

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN:

年卷期: 2015 年 06 期

页码: 1409-1416

收录情况: CSCD

摘要: 本研究旨在发掘牛更多的microRNA(miRNA)信息及新的miRNA序列,为进一步研究miRNA的生物学功能奠定理论基础。运用高通量测序技术对来自一头西门塔尔公牛和一头荷斯坦母牛的多个组织的小RNA进行混池测序,对测序结果进行了生物信息学分析。随机选取了一条成熟miRNA:bta-miR-2346-5p和两条新预测的miRNAs:novel_miR-48和novel_miR-86,采用茎环RT-PCR进行验证。共鉴定了604条miRNAs,其中429条为牛的已知miRNAs,175条为新预测的miRNAs。通过茎环RT-PCR发现选取的这3条miRNAs在背最长肌、心肌、肝脏、脾脏、肺脏、...

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