军曹鱼MHC-Ⅱβ基因全长cDNA的克隆与组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 茅莉娜

作者： 茅莉娜;冯娟;李玉谷;侯月娥;郭志勋;许海东

作者机构：

关键词： 军曹鱼;MHC-Ⅱβ;全长cDNA;组织特异性表达

期刊名称： 动物学杂志

ISSN： 0250-3263

年卷期： 2010 年 45 卷 04 期

页码： 118-128

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)的方法,得到1161bp的军曹鱼(Rachycentron canadum)MHC-Ⅱβ全长cDNA片段。该序列包括20bp的5′末端非编码区(UTR),394bp的3′UTR及747bp的开放阅读框(ORF),编码248个氨基酸,预测其蛋白质分子量约为27.99ku,等电点为6.21。通过构建MHC-Ⅱβ氨基酸序列的系统进化树,并进行氨基酸相似性比对,结果表明,军曹鱼和已知鱼类、鼠(Musmusculus)、鸡(Gallus gallus)及人类(Homo sapiens)MHC-Ⅱβ氨基酸的同源性在28.5%～77.5%之间。所推测的蛋白序列具有一些重要的特征,包括:前导肽、β1、β2和CP/TM/CYT区,保守的半胱氨酸等。Real-time PCR检测结果显示,MHC-Ⅱβ基因在正常军曹鱼组织中均表达,但表达量在各个组织中不同,其中,头肾表达较强,鳃、脾、肠表达程度中等,在心、脑、肌肉中表达较弱。

分类号： S917.4`Q78

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