基于5.8S rDNA和ITS序列探讨亚洲瓠瓜的地理分化

文献类型: 中文期刊

第一作者: 周先治

作者: 周先治;陈阳;陈晟;吴宇芬;赵依杰

作者机构:

关键词: 5.8S rDNA;亚洲瓠瓜;内转录间隔区;地理分化

期刊名称: 中国蔬菜

ISSN: 1000-6346

年卷期: 2011 年 1 卷 06 期

页码: 49-53

收录情况: 北大核心

摘要: 基于5.8S rDNA及ITS序列对23份来自中国、泰国和日本的亚洲瓠瓜品种进行了地理分化研究。结果发现,23份瓠瓜材料的ITS1+5.8S rDNA+ITS2序列的长度在611~627bp之间,G+C含量在54.17%~63.26%之间,信息位点数65个,占总碱基数的11.09%;源自日本的2份瓠瓜品种的序列长度短于其他21份瓠瓜品种,G+C含量也明显低于其他瓠瓜品种。从5.8S rDNA及ITS序列构建的系统树可以看出,源自日本的瓠瓜品种与源自中国和泰国的瓠瓜品种存在地理分化现象,分属于不同的分支,支持率达到99%。序列间的同质性检验结果显示,2份源自日本的瓠瓜品种与源自中国和泰国的瓠瓜品种差异显著。

分类号: S642.9

  • 相关文献

[1]七种骨舌鱼核糖体序列特征及遗传发育分析. 杨叶欣,刘奕,刘超,宋红梅,汪学杰,牟希东. 2022

[2]国家基因库野生大豆微核心样本遗传变异性的SSR标记分析. 刘亚男,李向华,王克晶. 2009

[3]基于rDNA ITS和ISSR标记研究四川松茸遗传多样性. 李小林,黄文丽,熊川,杨志荣,郑林用. 2014

[4]欧洲与东亚小麦品种遗传多样性的比较分析. 王兰芬,BALFOURIERF,郝晨阳,EXBRAYAT-VINSONF,董玉琛,盖红梅,张学勇. 2007

[5]新疆蟾蜍的遗传变异与地理分化. 叶小芳,吕雪峰,袁亮,王秀玲,季荣. 2017

[6]18个贵州红托竹荪种质资源的遗传多样性. 卢颖颖,桂阳,龚光禄,魏善元,朱国胜. 2014

[7]天津地区保护地蔬菜根结线虫种类的分子鉴定. 霍建飞,任文来,刘春艳,王勇,田涛,郝永娟,王万立,万久兴. 2012

[8]鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITS rDNA序列测定及种系发育关系分析. 张媛,林瑞庆,赵光辉,袁子国,宋慧群,朱兴全. 2009

[9]基于rDNA-ITS和组蛋白3基因序列分析鉴定新疆棉花叶斑病病原. 李映程,张国丽,任毓忠,李海强,武刚,李天义,李国英,张莉. 2018

[10]新月弯孢CLE菌株胞外蛋白对水稻纹枯病的诱导抗性及其菌种鉴定. 王玲,黄世文,唐绍清,朱德峰,王磊. 2008

[11]两株椰心叶甲分离物的鉴定及其系统发育分析. 郭立佳,黄俊生,宋妍,许天委. 2007

[12]甘肃首次发现大豆孢囊线虫(Heteroderaglycines). 彭德良,黄文坤,徐秉良,彭焕. 2015

[13]黑龙江省大豆菌核病菌核盘菌遗传多样性分析. 董利东,王金生,李文滨,吴俊江,范素杰,徐鹏飞,张淑珍. 2015

[14]rDNA ITS序列在果树真菌病害研究中的应用. 索相敏,王献革,李学营,郝婕,鄢新民,冯建忠. 2015

[15]番石榴焦腐病菌LAMP检测方法的建立及应用. 吴敏亮,张溢溪,兰成忠,刘裴清,李本金,陈庆河,翁启勇. 2013

[16]奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼rDNA内转录间隔区序列特征. 陈雪峰,李红霞,俞菊华,唐永凯,李建林. 2009

[17]我国不同地区熊蜂短膜虫的感染情况及亲缘关系. 唐裕杰,王刘豪,李凯,李继莲. 2019

[18]白菜类作物ITS序列分析. 高玉梅,张淑江,章时蕃,李菲,王晓武,武剑,孙日飞. 2009

[19]我国耳萝卜螺ITS及5.8SrDNA的克隆及序列分析. 王瑞爱,刘国华,王春仁,张念章,翁亚彪. 2013

[20]内转录间隔区1(ITS-1);用于伊氏锥虫遗传多样性分析的一个争议性标记基因. 田占成,刘光远,谢俊仁,沈辉,张丽艳,张萍,罗金. 2011

作者其他论文 更多>>