21种植物八氢番茄红素合成酶的生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李宁
作者: 李宁;王柏柯;杨生保;唐亚萍;王强;杨涛;帕提古丽;余庆辉
作者机构:
关键词: 八氢番茄红素合成酶;系统进化;生物信息学分析
期刊名称: 新疆农业科学
ISSN: 1001-4330
年卷期: 2015 年 52 卷 12 期
页码: 2157-2165
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】对番茄等21种植物的八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)进行生物信息学分析,为研究植物八氢番茄红素合成酶的结构与功能分析奠定基础。【方法】采用Blast、Prot Param和Signal P等生物信息学软件,对番茄、拟南芥、辣椒和胡萝卜等21种植物PSY的理化性质、蛋白结构和系统发生树等进行分析。【结果】21种植物PSY氨基酸不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测PSY可能定位于细胞质叶绿体中发挥功能,二级结构由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成。【结论】PSY蛋白为较不稳定亲水性蛋白,亚细胞定位于叶绿体上。不经过跨膜转运,而是直接在细胞质基质中形成。
分类号: Q946.5`Q811.4
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