21种植物八氢番茄红素合成酶的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李宁

作者: 李宁;王柏柯;杨生保;唐亚萍;王强;杨涛;帕提古丽;余庆辉

作者机构:

关键词: 八氢番茄红素合成酶;系统进化;生物信息学分析

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2015 年 52 卷 12 期

页码: 2157-2165

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】对番茄等21种植物的八氢番茄红素合成酶(phytoene synthase,PSY)进行生物信息学分析,为研究植物八氢番茄红素合成酶的结构与功能分析奠定基础。【方法】采用Blast、Prot Param和Signal P等生物信息学软件,对番茄、拟南芥、辣椒和胡萝卜等21种植物PSY的理化性质、蛋白结构和系统发生树等进行分析。【结果】21种植物PSY氨基酸不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测PSY可能定位于细胞质叶绿体中发挥功能,二级结构由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成。【结论】PSY蛋白为较不稳定亲水性蛋白,亚细胞定位于叶绿体上。不经过跨膜转运,而是直接在细胞质基质中形成。

分类号: Q946.5`Q811.4

  • 相关文献

[1]高粱WRKY家族成员鉴定及生物信息学分析. 赵兴奎,范昕琦,聂萌恩,王海燕,柳青山,段永红. 2020

[2]牦牛DJ-1基因克隆、生物信息学及组织表达分析. 申金伟,路建卫,赵雪,扎老,成述儒,梁春年. 2024

[3]四倍体小麦GPAT基因家族比较分析. 师毅君,王康君,郭明明,张广旭,谭一罗,李晓峰,何茂盛,徐大勇,樊继伟. 2023

[4]牦牛GOLT1B基因克隆及生物信息学分析. 申金伟,路建卫,杨文艳,马莉莉,牟亮,扎老,成述儒,梁春年. 2023

[5]梅花鹿GHR基因完整编码区序列生物信息学分析. 宋兴超,杨福合,巴恒星,邢秀梅,魏海军. 2012

[6]美仁牦牛ILK基因克隆及生物信息学分析. 任稳稳,马海梅,马晓明,吴晓云,喇永福,郭宪,褚敏,包鹏甲,阎萍,梁春年. 2023

[7]黄秋葵八氢番茄红素合成酶PSY基因的克隆与分析. 李永平,陈敏氡,朱海生,温庆放,刘建汀,林思锻. 2019

[8]辣椒八氢番茄红素合成酶鉴定、进化与表达分析. 郑佳秋,梅燚,吴永成,王薇薇,张丽娜,张永吉,陈以博,祖艳侠,万红建. 2022

[9]草莓八氢番茄红素合成酶基因的克隆及其表达特性. 朱海生,李永平,温庆放. 2011

[10]香蕉八氢番茄红素合成酶基因MsPSY2a功能鉴定. 谢龙海,高洁,荆永琳,徐立,陈莹,薛丙涛,李志英. 2021

[11]基于PSY2基因单碱基突变的木薯薯肉颜色分子标记开发与利用. 朴朴森,尚小红,许丰收,廖明馨,王明,严华兵,陈新,王文泉. 2022

[12]草莓八氢番茄红素脱氢酶基因pds的克隆及特征分析. 朱海生,李永平,温庆放,林珲. 2011

[13]西瓜八氢番茄红素合成酶基因片段的克隆和序列分析. 康保珊,赵文恩. 2007

[14]西双版纳黄瓜Cs-Psy1基因的序列特征与表达分析. 卢萍,王柬人,李锡香,宋江萍,邱杨,王海平,张晓辉,沈镝. 2016

[15]西瓜八氢番茄红素合成酶基因全长的克隆与表达分析. 吕品,李娜,刘慧,赵文恩. 2014

[16]不同成熟果色辣椒中PSY1基因的差异表达分析. 陶功臣,马玉杰,文军琴,王亚艺,李全辉. 2024

[17]中国矮马群体mtDNA Cytb基因遗传多样性及系统进化研究. 徐龙鑫,杨胜林,李爱萍,乜玉丽,杨海兵,戴焰. 2013

[18]线粒体DNA的研究与应用. 熊庆,刘作易,喻子牛. 2002

[19]链霉菌ACCC40021的多基因系统进化分析. 董晓霞,崔西苓,张晓霞,李世贵,马晓彤,李艳菊,顾金刚. 2014

[20]水稻细菌性谷枯病菌的分子鉴定及16S rDNA序列分析. 周求根,兰波,徐沛东,李湘民,杨迎青. 2014

作者其他论文 更多>>