简并PCR扩增小瓜虫抑动抗原基因的ORF

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨金先

作者： 杨金先;陈强;刘晓东;林天龙;Theodore G.Clark

作者机构：

关键词： 小瓜虫;抑动蛋白;抗原;简并PCR

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2004 年 11 卷 02 期

页码： 135-138

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 抑动蛋白是小瓜虫(Ichthyophthiriusmultifiliis)体表纤毛的主要构成部分,也是宿主免疫系统发挥抗虫免疫时的主要识别抗原。根据已经报道的3种抑动蛋白N端及C端保守的多肽片断,设计了一对简并引物P6/P7,以小瓜虫分离株IchFJ9的基因组为模板,成功扩增了抑动蛋白编码区(ORF)的全长基因序列。扩增的iagFJ9基因全长1398bp,编码466个氨基酸,包含18个非标准密码子TAA(Glu,Q)推导的氨基酸序列包含6个以CPXGT为起始的串联重复单位,具有抑动蛋白的特征性结构。同源比较分析显示,扩增的iagFJ9基因与已知的小瓜虫抑动蛋白基因IAG52A基因具有88%同源率。证实了iagFJ9是一个新发现的抑动蛋白基因,用简并PCR技术去发现小瓜虫抑动蛋白基因家族新基因是可行的。

分类号： S941.5

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