SNP检测方法的研究进展
文献类型: 中文期刊
第一作者: 许家磊
作者: 许家磊;王宇;后猛;李强
作者机构:
关键词: SNP;基于凝胶电泳的检测方法;高通量自动化检测方法
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2015 年 13 卷 02 期
页码: 475-482
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 作为近年来最有发展潜力的第三代分子标记,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在遗传分析中得到了广泛应用。目前SNP的检测方法大致可以分为两大类:一大类是以单链构象多态性(SSCP)、变性梯度凝胶电泳(DDGE)、酶切扩增多态性序列(CAPS)、等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)等为代表的以凝胶电泳为基础的传统经典的检测方法。另一大类是以直接测序、DNA芯片、变性高效液相色谱(DHPLC)、质谱检测技术、高分辨率溶解曲线(HRM)等为代表的高通量、自动化程度较高的检测方法。本文综述了两大类SNP检测方法中主要检测技术的原理和应用,并分析在实际应用中各种检测技术的优缺点。
分类号: Q503
- 相关文献
[1]植物的单核苷酸多态性及其在作物遗传育种中的应用. 郝岗平,杨清,吴忠义,曹鸣庆,黄丛林. 2004
[2]草原红牛CAPN1基因第5外显子多态性与肉质性状的相关研究. 曹阳,牛春华,张国梁,金海国. 2009
[3]ARMS-PCR在水稻米香基因Fgr检测中的应用. 陈晓军,王敬东,殷延勃,马洪文,宋玉霞. 2011
[4]三疣梭子蟹线粒体基因组单核苷酸多态性. 赵莲,李志辉,张培,薛蓓,赖晓芳,高焕,阎斌伦. 2018
[5]三疣梭子蟹线粒体基因组SNP在增殖放流家系识别中的应用. 赵莲,李志辉,张培,薛蓓,赖晓芳,张庆起,高焕,阎斌伦. 2018
[6]SNP分子标记技术在经济甲壳动物中的应用进展. 赵莲,薛蓓,高焕,阎斌伦. 2017
[7]草原红牛改良群体H-FABP基因SNP及其与肉质性状的相关分析. 文力正,赵玉民,姜昊,张国梁,戴立胜,赵志辉,陈承祯,张嘉保. 2008
[8]斑点叉尾MSTN基因4个SNP位点及其与生长性状的相关性. 张世勇,王明华,钟立强,秦钦,潘建林,陈校辉,边文冀. 2017
[9]猪Toll样受体4基因SNPs功能分析. 杨秀芹,陈月婵,汪亮,李海涛,刘娣,关庆芝,付博. 2012
[10]绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析. 管毓渝,廖荣荣,王振,赵静,陈振亮,张哲,肖倩,孙浩,王起山. 2016
[11]斑点叉尾GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析. 张世勇,钟立强,秦钦,王明华,潘建林. 2016
[12]新疆绵羊SNP数据库系统的设计与实现. 罗鹏,张太红,贺三刚,朱先凤. 2014
[13]牛DES基因的SNPs检测. 狄江,Cynthia DK Bottema,Bozena Kruk. 2004
[14]蒺藜苜蓿、天蓝苜蓿、金花菜基因组SNP穿梭标记开发. 任海龙,魏臻武,陈祥. 2017
[15]建鲤IGFBP1基因的克隆及与增重相关的SNP位点分析. 魏可鹏,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,夏正龙. 2012
[16]基于复合EST-SSR标记的大白菜种子纯度鉴定及SNP位点获取. 赵新,王永,兰青阔,贺长征,陈锐,李欧静,刘娜,朱珠,郭永泽. 2013
[17]猪CD8B表达谱、基因多态性及其与血液免疫性状的关联分析. 许金根,王重龙,车传燕,蔡治华,李升和,张勤. 2016
[18]鸡脂肪酸脱氢酶基因多态性及其与脂肪酸含量的关联分析. 刘向萍,雷黎立,周琼,王克华,常国斌. 2010
[19]不同海拔下花叶海棠叶片转录组核苷酸变异分析和比较. 张得芳,夏涛,文怀秀,王占林,刘霞,张磊,白灵娜. 2017
[20]高邮鸭IGF-1基因SNP位点变异与骨骼肌生长发育相关性分析. 陶志云,朱春红,宋卫涛,徐文娟,刘宏祥,章双杰,李慧芳. 2016
作者其他论文 更多>>
-
粗饲料加工生产中除尘装置应用与发展
作者:王宇
关键词:牧场;规模化;舍饲;除尘装置;机械化
-
物理预处理对小麦麸皮-大豆混合蛋白功能性质的影响
作者:珠拉吉;王宇;吴红艳;马鑫蕊;姚爽;高海娟;王德香;许英一
关键词:小麦麸皮蛋白;大豆蛋白;超声;微波;功能性质
-
青贮饲料制备技术与品质影响因素研究进展
作者:柴艳;柯梅;侯钰荣;李强
关键词:青贮饲料;制备技术;发酵品质;饲料原料
-
基于船舶监测系统数据的拖网渔船捕捞努力量估算(英文)
作者:李丹;鲁峰;徐硕;王宇;薛沐涵;倪翰晨;方辉;张漫;马振华;陈作志;许建
关键词:拖网渔船;船位数据;机器学习;捕捞努力量
-
乡村自媒体短视频助力乡村农业发展
作者:纪晔;王宇;王文昊
关键词:
-
甘薯茎线虫病复合抗性遗传分析与QTL定位
作者:闫会;马居奎;李臣;马猛;张艾岑;张成玲;张允刚;李强
关键词:甘薯;茎线虫病;复合抗性;QTL定位
-
阴山北麓人工混播草地草种组合筛选
作者:许嘉逸;李强;温超;单玉梅;刘思博;晔薷罕;张丽华;殷国梅
关键词:豆禾混播;群落特征;营养品质;种间竞争;组合筛选
