河南斗鸡线粒体D-loop区多态性及与4种斗鸡的进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾晓旭

作者： 贾晓旭;陆俊贤;唐修君;唐梦君;樊艳凤;顾荣;高玉时;苏一军

作者机构：

关键词： 河南斗鸡;线粒体DNA;D-loop区;多态性;起源

期刊名称： 安徽农业大学学报

ISSN： 1672-352X

年卷期： 2015 年 42 卷 05 期

页码： 726-729

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对28只河南斗鸡线粒体基因组(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合Gen Bank中其他品种中国斗鸡D-loop区序列,进行序列比对和进化分析。结果发现,河南斗鸡mt DNA D-loop区全长1232 bp,单倍型多样性(Hd)为(0.542±0.086),核苷酸多样性(Pi)为(0.00236±0.00083),共发现9处单核苷酸多态位点,3种单倍型。品种间进化分歧显示,河南斗鸡和西双版纳斗鸡遗传距离最近(0.0095),与漳州斗鸡遗传距离最远(0.0226)。系统发育分析发现,5个斗鸡品种可以分成A、B、C、D和E 5个分支。研究表明,河南斗鸡mt DNA D-loop区呈中度多态,有2个母系起源,本研究可以为河南斗鸡的遗传资源保护和选育提供一定参考。

分类号： S831

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