60Co辐射诱导水稻短穗小粒突变体sp18的表型鉴定与基因定位
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈能刚
作者: 陈能刚;鄢小青;李欢;陈锋
作者机构:
关键词: 水稻;短穗;小粒;变异分析
期刊名称: 种子
ISSN:
年卷期: 2022 年 010 期
页码:
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用60Co辐射诱变贵州地方粳稻品种桥港珍珠米获得短穗小粒突变体sp18,鉴定其表型特征,并进行遗传与分子标记连锁分析,全基因组重组序列分析及突变基因分析。结果表明,与野生型相比,突变体sp18的株高增加,有效穗没有显著变化,而结实率、穗长、穗粒数和千粒重较野生型显著减少。利用水稻SSR标记进行初步定位,发现第11号染色体上的分子标记RM 167和RM 27150与目的基因连锁,物理距离分别为19.1 cM和41.5 cM处。突变体和野生型进行全基因组重测序分析,发现sp18在第11号染色体上缺失322 720 bp(7 189 868~7 512 630 bp之间)。在缺失区域内包括Os11g0235200、Os11g0235700、Os11g0235750、Os11g0236000、Os11g0236100、Os11g0236200、Os11g0237900、Os11g0238000、Os11g0238400、Os11g0238700、Os11g0239000、Os11g0239200、Os11g0239400、Os11g0239500、Os11g0240600和Os11g0240900。其中Os11g0235200编码肽转运蛋白,为已克隆的短穗基因sp1。Os11g0236000编码磷酸甘油二酯磷酸二酯酶家族蛋白,参与生长素信号传导。Os11g0239500和Os11g0240600均编码赤霉素受体GID 1 L 2,参与赤霉素的调控。因此,短穗小粒突变基因sp18为sp1的新等位基因,然而sp18突变体呈现出与sp1既相似而又不同的突变表型特征,推测可能是sp18基因组大片段缺失,包括多个与植物激素相关的基因的缺失而导致的。
分类号: S511
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