巴西橡胶树RALF基因家族的鉴定及其表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨洪

作者： 杨洪;王立丰;代龙军;赵溪竹

作者机构：

关键词： 巴西橡胶树;RALF;快速碱化因子;基因家族;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 019 期

页码： 6348-6355

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 快速碱化因子（rapid alkalinization factors, RALFs）是一种植物多肽类激素,参与胞内MAPK信号传递、细胞伸长调控、花器官发育及免疫应答等植物重要生理过程。本研究利用生物信息学方法对橡胶树RALF基因家族进行全基因组鉴定,对其序列特性、基因结构、保守基序、系统进化及表达特性进行系统研究。通过同源比对在橡胶树基因组中共鉴定到16个RALF基因,分别命名为HbRALF1～HbRALF16。序列分析结果表明,这些基因编码氨基酸数目介于108～149 aa之间,分子量和等电点分别介于11.92～16.88 kD和5.41～9.33。多序列比对结果表明,HbRALFs含有S1P蛋白酶识别位点、受体蛋白识别位点YISY保守序列和四个保守半胱氨酸。基于转录组数据的组织和乙烯刺激表达特性分析显示,16个橡胶树RALF基因至少在一个组织中表达,8个胶乳中高表达的RALF还参与乙烯刺激响应。本研究为进一步研究RALF基因家族在橡胶树关键农艺性状调控中的作用提供参考依据。

分类号： S794.1

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