水稻黑条矮缩病毒基因组片段S7的cDNA克隆及全序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张恒木
作者: 张恒木;陈剑平;雷娟利;程晔;薛庆中
作者机构:
关键词: 水稻黑条矮缩病毒;基因组片段S7;序列分析
期刊名称: 微生物学报
ISSN: 1005-7021
年卷期: 2002 年 42 卷 02 期
页码: 200-207
收录情况: 北大核心
摘要: 应用RT PCR技术克隆了 2个水稻黑条矮缩病毒 (riceblack streakeddwarfvirus,RBS DV)中国分离物 ,即浙江分离物和河北分离物的基因组片段S7,并测定了他们的全序列。结果表明 :RBSDV浙江分离物 (RBSDV Zj)基因组片段S7全长 2 1 93nts(EMBL登录号为AJ2 9742 7) ,RBSDV河北分离物基因组片段S7全长 2 1 90nts(EMBL登录号为AJ2 9742 8) ,二者均含有两个开放阅读框 (openreadingframe,ORF) ,分别编码约 41kD和 3 6kD多肽 ,2个中国分离物核苷酸同源性高达 99% ,相应的ORF编码的多肽同源性分别为 1 0 0 %和 94 4% ,与日本RBSDV基因组片段S7核苷酸同源性为 93 4%和 93 8% ,相应ORF编码的多肽同源性分别为98 1 % (ORF1 )、96 5 %和 97 8% (ORF2 ) ,与意大利MRDVS6核苷酸同源性为 85 1 %和85 3 % ,相应多肽同源性分别为 92 3 % (ORF1 )、85 5 %和 86 8% (ORF2 )。
分类号: S432.41`S435.111
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