文献类型： 中文期刊
第一作者： 王兴强
作者： 王兴强;卢雪旎;沈晔;曹梅;韦寿永;李庆国;茆丹婷;秦传新
作者机构：
关键词： 脊尾白虾;环境胁迫;转录组分析;差异表达基因;高通量测序
期刊名称： 江苏农业科学
ISSN： 1002-1302
年卷期： 2022 年 50 卷 003 期
页码： 22-27
收录情况： 北大核心
摘要： 脊尾白虾(Palaemon carinicauda)是我国沿海滩涂混养的重要经济虾类,具有广盐、广温、抗病力和繁殖力强等优点.采用高通量测序技术对脊尾白虾转录组进行测序,对得到的转录本进行COG(clusters of orthologous groups)、GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)分类和注释,旨在深入探讨环境胁迫(低盐、低温和溶解氧)对脊尾白虾重要相关调控基因的影响.本次测序低盐、低温和溶解氧处理组和对照组均产出>35×106条高质量序列,碱基数均>4 Gb,GC含量均>43%,Q30碱基百分比均>92%.组装得到转录本436 023条和unigene 305 682条,转录本和unigene的N50分别是814 bp和552 bp.unigene大部分(56 898条)注释到NR数据库,31 695条注释到KEGG数据库,28 919条注释到GO数据库.低温胁迫产生的差异表达基因中,具有显著性表达差异的有264条,包括上调基因215条和下调基因49条;低氧胁迫没有产生显著差异表达的基因,反观低盐胁迫有且仅有1条显著下调的基因,为α-葡糖苷酶(α-glucosidase).低盐胁迫下α-葡萄糖苷酶表达量显著降低,可能导致脊尾白虾虾体难以维持正常的能量需求.GO富集分析发现,低温胁迫下最显著的功能节点是脂质转运活性(lipid transporter activity)和肽基二肽酶活性(peptidyl-dipeptidase activity);而KEGG通路富集分析显示,差异表达基因显著富集到肾素-血管紧张素系统(renin-angiotensin system)中,推测低温通过抑制血管紧张素转换酶(angiotensin converting enzyme)的表达,降低了血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ)的生成,从而降低血管平滑肌张力,抑制血压的升高和组织损伤;同时动员脂肪和蛋白质等能源物质,以响应低温胁迫.
分类号： S917.4
- 相关文献
作者其他论文 更多>>
-
基于Ecopath模型的增殖放流对南朗水域生态系统的影响
作者：冯瑞玉;陶峰;郭禹;秦传新;孙金辉;吴一桂;王静
关键词：Ecopath模型;增殖放流;生态系统;营养结构;生态容纳量;南朗水域
-
深水网箱养殖对海域水质及底质环境的影响研究进展
作者：葛伟宏;王兴强;苏家齐
关键词：深水网箱养殖;水环境;表层沉积环境;成鱼质量
-
黑龙江省东部地区大豆生产情况调研报告
作者：张振宇;李灿东;郭泰;王兴强;张明秀;张颖;王艳华;盖学峰
关键词：黑龙江省东部地区;大豆;生产情况
-
红鳍笛鲷幼鱼对不同开孔形状和尺寸人工鱼礁模型的行为偏好探究
作者：江满菊;郭禹;秦传新;辛益;赵心冉;于刚;马振华;杨育凯
关键词：人工鱼礁;红鳍笛鲷;诱集效果;行为响应
-
现代化海洋牧场增养殖方式及用海分类体系探讨
作者：潘天国;李光明;岳维忠;秦传新;索安宁
关键词：现代化海洋牧场;增养殖方式;用海类型;用海方式;用海管理
-
基于sRNA的脊尾白虾对低温胁迫的响应研究
作者：陈吉圣;卢雪旎;王兴强;曹梅;李永;秦传新
关键词：低温胁迫;sRNA;miRNA;脊尾白虾
-
黄鳍棘鲷幼鱼对不同开孔形状和直径的人工鱼礁模型的行为响应
作者：江满菊;郭禹;秦传新;潘莞倪;于刚;马振华
关键词：人工鱼礁;趋礁行为;黄鳍棘鲷;行为响应
