基于重测序的芥蓝(Brassica alboglabra)全基因组InDel标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 洪晓如

作者： 洪晓如;吴智明;陈汉才;黎庭耀;沈卓;张艳

作者机构：

关键词： 芥蓝（Brassica alboglabra）;重测序;InDel标记

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 1190-1201

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 碱基插入/缺失（InDel）在基因组中的分布密度仅次于SNP且易于基因型分型,成为分子标记开发的主要来源。为了开发芥蓝品种间有多态性的分子标记,本研究利用2份芥蓝自交系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了367对InDel候选标记。通过PCR检测比较8个芥蓝自交系的多态性,发现284对标记在至少2个芥蓝自交系间有多态性,阳性率为77.4%。本研究利用重测序技术开发芥蓝品种间InDel标记效率较高,为种质资源分析、基因定位、分子标记辅助育种等提供了便捷工具。

分类号： S635.9

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