基于BSA-seq的大豆棕色荚皮L2基因定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 樊超

作者： 樊超;毕影东;李炜;梁文卫;刘淼;刘建新;杨光;邸树峰

作者机构：

关键词： 大豆;荚皮颜色;基因定位;BSA-seq

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2024 年 39 卷 004 期

页码： 64-71

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大豆荚皮的颜色是重要的驯化性状和表型特征，与炸荚习性和躲避捕食关系紧密。大豆荚皮颜色主要由2对等位基因控制，其中棕色荚皮L2基因尚未被鉴定。为了在大豆基因组上对该基因进行鉴定，为大豆棕色荚皮相关基因功能解析和育种应用提供一定的理论基础。以栽培大豆中龙优203（黄色荚皮）和野生大豆FF1235（黑色荚皮）为亲本构建F2分离群体进行遗传分析。利用F2群体棕色豆荚和黄色豆荚单株构建混池进行BSA-seq定位分析，并在此基础上进行重组交换单株分析。结果表明，大豆棕色荚皮性状为1对等位基因控制的质量性状。棕色荚皮L2基因关联区域位于3号染色体0～0.75 Mb的区段。进一步开发InDel分子标记进行精细定位，获得具有多态性的InDel引物7对。最终将棕色荚皮位点定位于3号染色体上的Indel-L2-3～Indel-L2-6,物理距离为344 kb。定位区间内共有候选基因32个，其中Glyma.03G005700基因注释为异丙基苹果酸聚合酶，与已发现的黑色荚皮基因L1（Glyma.19G120400）高度同源，其功能为将4-羟基丙酮酸转化为红果酸和番石榴酸，可能是调控大豆棕色荚皮形成的关键基因。

分类号： S565.1

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