基于加权基因共表达网络分析探究桑树光合相关基因的调控模式

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李勇

作者： 李勇;黄锦;于翠;莫荣利;朱志贤;董朝霞;胡兴明;邓文

作者机构：

关键词： 加权基因共表达网络分析;桑树;光合相关基因

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2022 年 61 卷 024 期

页码： 163-169

收录情况： 北大核心

摘要： 基于前期桑树转录组数据和光合表型数据,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)共获得10个基因模块与表型关联,筛选到MEmagenta、MEgreen、MEyellow、MEpurple和MEblack光合相关基因模块.GO和KEGG分析显示,DEGs显著富集在光合相关酶活性、碳代谢和固碳等途径,筛选到12个与光合作用高度相关的基因.通过RNA-seq结合WGCNA分析,筛选了3个光合关键基因,即光系统Q(B)蛋白L484_000029基因、核糖二磷酸羧化酶L484_000836基因、核糖二磷酸羧化酶/加氧酶激活酶2 L484_025354基因.该结果为进一步研究桑树光合作用调控机理提供支持.

分类号： S888.2

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