高油酸油菜成熟期种子转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张振乾

作者： 张振乾;常涛;王晓丹;王峰;王国槐;邬贤梦;胡琼;官春云

作者机构：

关键词： 高油酸油菜;转录组;定量PCR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 1731-1745

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了找出差异基因用于高油酸油菜育种,对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4%和56.2%)成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析。Illumina Hiseq TM2000测序得到8.09 Gb clean reads,组成52 361个unigene,平均长度为659 bp。比对公共数据库得到48 911(93.41%)个氨基酸序列。鉴定出6 414个在高油酸油菜和低油酸油菜中差异显著的基因,这些基因有1 296个在高油酸油菜中上调表达(20.21%),5 118个下调表达(79.79%),共有2 043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930,Bna0104450和Bna0305890在高油酸油菜中上调表达,其余的下调表达。Bna0501620,Bna0391450和Bna0084310在高油酸油菜中的表达量超过低油酸油菜中表达量2倍以上,分别为4.48倍,4.21倍和2.26倍。这些新发现的差异基因可用于高油酸油菜分子育种研究。

分类号： S565.4

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