稻曲病菌基因组DNA提取方法比较与小文库构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 伏荣桃

作者： 伏荣桃;王剑;陈诚;龚学书;卢代华;罗曦;郑爱萍

作者机构：

关键词： 稻曲病菌;CTAB;SDS;基因组小文库

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 102-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 水稻稻曲病是由稻曲病菌引起的真菌病害,现已成为水稻重要的病害之一。旨在寻找一种最佳的稻曲病菌基因组DNA提取方法,并构建基因组小文库。采用CTAB、SDS和真菌DNA试剂盒3种提取方法提取稻曲病菌基因组DNA,并用Illumina系统测序分析,构建基因组小文库。结果显示,CTAB提取法能得到高质量的基因组DNA,小文库测序组装共得29 350288碱基(bp)和17 908 Scaffold,总碱基的GC含量为49.79%。CTAB提取法是稻曲病菌基因组DNA最佳的提取方法,基因组小文库成功的构建为稻曲病菌的基因组gap的填补和致病相关基因的鉴定提供了数据资源。

分类号： S435.111.4

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