Polymorphic microsatellite loci for Japanese Spanish mackerel (Scomberomorus niphonius)

文献类型: 外文期刊

第一作者: Lin, L.

作者: Lin, L.;Zhu, L.;Liu, S. -F.;Tang, Q. -S.;Zhuang, Z. -M.;Lin, L.;Su, Y. -Q.

作者机构:

关键词: Scomberomorus niphonius;Japanese Spanish mackerel;Microsatellite loci;Population structure

期刊名称:GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH ( 影响因子:0.764; 五年影响因子:0.912 )

ISSN: 1676-5680

年卷期: 2012 年 11 卷 2 期

页码:

收录情况: SCI

摘要: We isolated and characterized 21 polymorphic microsatellite loci in Japanese Spanish mackerel (Scomberomorus niphonius) using a (GT)(13)-enriched genomic library. Forty individuals were collected from Qingdao, China. We found 3 to 24 alleles per locus, with a mean of 8.8. The observed and expected heterozygosities ranged from 0.263 to 0.975 and from 0.385 to 0.946, with means of 0.655 and 0.685, respectively. Deviation from Hardy-Weinberg proportions was detected at three loci. Two loci showed evidence for null alleles. These microsatellite markers will be useful for population genetic analysis of Japanese Spanish mackerel.

分类号:

  • 相关文献

[1]Development and characterization of microsatellite markers of the eastern keelback mullet (Liza affinis). Liu, L.,Song, N.,Gao, T. X.,Han, Z. Q.,Li, C. H.,Sun, D. R.. 2016

[2]Polymorphic microsatellite loci for the Japanese anchovy Engraulis japonicus (Engraulidae). Lin, L.,Zhu, L.,Liu, S. -F.,Zhuang, Z. -M.,Lin, L.,Su, Y. -Q.. 2011

[3]Genetic structure of Larimichthys polyactis (Pisces: Sciaenidae) in the Yellow and East China Seas inferred from microsatellite and mitochondrial DNA analyses. Kim, Jin-Koo,Min, Gi-Sik,Yoon, Moongeun,Kim, Yeonghye,Choi, Jung Hwa,Oh, Taeg Yun,Ni, Yong.

[4]Twelve polymorphic microsatellite loci from a dinucleotide-enriched genomic library of Japanese Spanish mackerel (Scomberomorus niphonius). Xing, Shi-Chao,Xu, Gen-Bo,Liao, Xiao-Lin,Chen, Song-Lin,Xing, Shi-Chao,Yang, Guan-Pin.

[5]Novel polymorphic microsatellite markers isolated from the pen shell Atrina pectinata (Mollusca: Bivalvia: Pinnidae). Wu, B.,Bai, L. J.,Yang, A. G.,Zhou, L. Q.,Liu, Z. H.,Bai, L. J.. 2014

[6]Development and characterization of microsatellite markers for genetic analysis of Moerella iridescens Benson, 1842. Li, Xiaoying,Dong, Zhiguo,Zhao, Manman,Wang, Meizhen,Chen, Hanchun,Chang, Yumei.

[7]Genetic diversity and differentiation of Acanthoscelides obtectus Say (Coleoptera: Bruchidae) populations in China. Duan, Canxing,Zhu, Zhendong,Wang, Xiaoming,Li, Wanchang,Bao, Shiying.

[8]A set of new microsatellite loci isolated from Chinese mitten crab, Eriocheir sinensis. Chang, Yu Mei,Liang, Li Qun,Li, Shao Wu,Ma, Hai Tao,He, Jian Guo,Sun, Xiao Wen. 2006

[9]Isolation and characterization of microsatellite loci from an endangered tree species, Toona ciliata var. pubescens. Liu, J.,Chen, Y. -T.,Jiang, J. -M.,Sun, Z. -X.. 2012

[10]Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci in Aleurodicus dispersus (Hemiptera, Aleyrodidae). Ma, G. -C.,Niu, L. -M.,Fu, Y. -G.,Wu, X.,Ma, C. -L.,Wu, H. -L.,Hu, H. -Y.. 2011

[11]Isolation and characterization of fourteen novel microsatellite loci from Brachymystax lenok tsinlingensi. Liu, Qiao,Li, Yang,Liu, Xiaolin,Liang, Hongwei. 2015

[12]Polymorphic microsatellite loci for the crimson snapper (Lutjanus erythropterus). Liu, L.,Lin, L.,Li, C. H.,Xu, S. N.,Liu, Y.,Lin, L.,Li, C. H.,Xu, S. N.,Liu, Y.,Liu, L.,Zhou, Y. B.. 2014

[13]Seventeen polymorphic microsatellite markers developed for the Javelin goby, Synechogobius hasta (Gobiidae). Bai, C. -C.,Liu, S. -F.,Zhuang, Z. -M.,Yuan, Y. -J.,Liu, H. -B.,Dai, F. -Q.,Bai, C. -C.,Liu, H. -B.,Yuan, Y. -J.. 2012

[14]Isolation and characterization of 48 polymorphic microsatellite markers for the blood clam Scapharca broughtonii (Arcidae). Tian, J. -T.,Liu, Z. -H.,Zhou, L. -Q.,Wu, B.,Liu, P.,Yang, A. -G.,Tian, J. -T.. 2012

[15]Multiple paternity in the cultured yellow pond turtles (Mauremys mutica). Zhang, Xin-cheng,Zhu, Xin-ping,Zhang, Xin-cheng,Zhao, Jian,Li, Wei,Wei, Cheng-qing,Zhu, Xin-ping.

[16]Isolation and characterization of 16 microsatellite loci in an endangered fish Ussuri cisco, Coregonus usssruensis. Yu, Dongmei,Peng, Jianjun,Ma, Bo,Sun, Yanhong.

[17]Association mapping of yield-related traits and SSR markers in wild soybean (Glycine sofa Sieb. and Zucc.). Hu, Zhenbin,Zhang, Dan,Zhang, Guozheng,Kan, Guizhen,Hong, Delin,Yu, Deyue,Hu, Zhenbin,Zhang, Dan. 2014

[18]Analysis of genetic diversity and population structure in a tomato (Solanum lycopersicum L.) germplasm collection based on single nucleotide polymorphism markers. Wang, T.,Wang, T.,Zou, Q. D.,Qi, S. Y.,Wang, X. F.,Wu, Y. Y.,Zhang, Y. M.,Zhang, Z. J.,Li, H. T.,Liu, N.. 2016

[19]SNP-revealed genetic diversity in wild emmer wheat correlates with ecological factors. Chen, Liang,Sun, Daokun,Peng, Junhua,Ren, Jing,You, Frank M.,Wang, Jirui,Luo, Ming-Cheng,You, Frank M.,Peng, Yunliang,Nevo, Eviatar,Beiles, Avigdor,Sun, Dongfa,Peng, Junhua. 2013

[20]Mitochondrial DNA reveals low population differentiation in elongate loach, Leptobotia elongata (Bleeker): implications for conservation. Zhou, Dinggang,Liu, Guangxun,Zhou, Jian. 2012

作者其他论文 更多>>
  • EFFECTS OF DIFFERENT SUBSTRATE ADDITIONS ON GROWTH STATUS OF SUBMERGED PLANTS AND RHIZOSPHERE MICROORGANISMS IN SEDIMENTS

    作者:Chen, W. F.;Xu, Y. F.;Li, S. M.;Feng, L. H.;Xia, X. X.;Huang, X. L.;Zhu, L.;Zhao, J. W.

    关键词:submerged macrophyte; sediment modifying; growth and ecophysiological; synergistic effect; microenvironment

  • The 2024 Outline of Fungi and fungus-like taxa

    作者:Hyde, K. D.;Thiyagaraja, V;Kularathnage, N. D.;Li, Y. C.;Wang, Z. Y.;Zhao, Q.;Hyde, K. D.;Wijesinghe, S. N.;Armand, A.;Chethana, K. W. T.;Perera, R. H.;Phukhamsakda, C.;Wannasawang, N.;Asghari, R.;Aumentado, H. D. R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Gajanayake, A. J.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S. C.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Kularathnage, N. D.;Lestari, A. S.;Li, C.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luangharn, T.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Meng, Q. F.;Mukhopadhyay, S.;Pathirana, L. S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phongeun, S.;Shu, Y. X.;Silva, V. S. H.;Su, H.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Thakshila, S. A. D.;Walker, A.;Wei, D. P.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yang, Y. Y.;Yu, F. M.;Yuan, L. L.;Zeng, M.;Zhang, J. Y.;Zhao, H. J.;Zhu, X. Y.;Hyde, K. D.;Noorabadi, M. T.;Chen, Y. P.;Manawasinghe, I. S.;Xu, B.;Yang, Y. H.;He, M. Q.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Biketova, A. Y.;Biketova, A. Y.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gomdola, D.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Rathnayaka, A. R.;Shu, Y. X.;Su, H.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Erdogdu, M.;Ge, Z. W.;Groenewald, J. Z.;Crous, P. W.;Groenewald, M.;Hernandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Hongsanan, S.;Khuna, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Leontyev, D., V;Leontyev, D., V;Li, D. W.;Lin, C. G.;Liu, N. G.;Lu, Y. Z.;Tian, X. G.;Yang, Y.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Liu, J. K.;Liu, J. W.;Madhushan, A.;Tian, W. H.;Zhang, S.;May, T. W.;Davoodian, N.;Piatek, M.;Czachura, P.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Ronikier, A.;Stryjak-Bogacka, M.;Worobiec, G.;Samarakoon, M. C.;Cheewankoon, R.;Chen, C.;Haituk, H.;Selcuk, F.;Ulukapi, M.;Senanayake, I. C.;Senanayake, I. C.;Tanney, J. B.;Vizzini, A.;Wanasinghe, D. N.;Dissanayake, A. J.;Wijayawardene, N. N.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Jayasiri, S. C.;Karunarathna, S. C.;Liu, X. F.;Lu, L.;Tibpromma, S.;Xu, R. F.;Zhao, R. L.;Cao, B.;Chen, Q.;Li, J.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wei, X.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Abeywickrama, P. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Chaiwan, N.;Samaradiwakara, N. P.;Tennakoon, D. S.;Acharya, K.;Afshan, N. S.;Khalid, A. N.;Muhammad, U.;Najam Ul Sehar, A.;Naseer, A.;Niazi, A. R.;Sarwar, S.;Usman, M.;Afzalinia, S.;Ahmadpour, S. A.;Eisvand, P.;Mehrabi-Koushki, M.;Safi, A.;Akulov, O.;Alizadeh, A.;Alizadeh, M.;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alves, A.;Alves, V. C. S.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Antonin, V;Sevcikova, H.;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Arias, R. M.;Heredia, G.;Asgari, B.;Zare, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Lima, J. M. S.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A. de;Mendes-Alvarenga, R. L.;Moura, J. C.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Assyov, B.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bakhshi, M.;Druzhinina, I. S.;Bao, D. F.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, K. D.;Lima, J. L. R.;Nascimento, E. C. R.;Oliveira, N. V. L.;Queiroz, M. B.;Silva, H. F.;Barbosa, F. R.;Baroncelli, R.;Barreto, G. G.;Gusmao, L. F. P.;Baschien, C.;Schoutteten, N.;Bennett, R. M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett, R. M.;Bezerra, J. D. P.;Carvalho, T. G.;Bianchinotti, M., V;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Bonito, G. M.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bortnikov, F. M.;Fedosova, A. G.;Novozhilov, Y. K.;Zmitrovich, I., V;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Burgaud, G.;Buyck, B.;Caeiro, M. F.;Cabarroi-Hernandez, M.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Feng, Cai M.;Cai, L.;Feng, Cai M.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J.;Garcia-Sanchez, D.;Gene, J.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Catania, M. D., V;Salvador-Montoya, C. A.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M.;Stadler, M.;Chaiwan, N.;Haituk, H.;Chakraborty, N.;Chen, J.;Chinaglia, S.;Garzoli, L.;Marchese, P.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Menolli Jr, N.;Zabin, D. A.;Coleine, C.;Selbmann, L.;Zucconi, L.;Costa-Rezende, D. H.;Cortes-Perez, A.;Crouch, J. A.;Cruz, R. H. S. F.;Damm, U.;Daroodi, Z.;Mamarabadi, M.;Das, K.;Das, K.;Davydov, E. A.;da Silva, I. R.;Dai, Y. C.;Michiel, de Groot D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Schoutteten, N.;De Kesel, A.;de Medeiros, E., V;de Souza, C. F. A.;de Souza, F. A.;Decock, C.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Deng, Y. L.;Dong, J. H.;Gu, Z. R.;Yang, X.;Yuan, Q.;Zhang, X. C.;Zhao, C. L.;Zhou, H. M.;Dentinger, B. T. M.;Dentinger, B. T. M.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, Y.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Dolatabadi, S.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Vinzelj, J. M.;Youssef Noha, H.;Egidi, E.;Fan, L.;Fan, X.;Fan, X. L.;Ferro, L. O.;Fonseca, E. O.;Nascimento, S. S.;Oliveira Junior, I;Prazeres, J. F. S. A.;Fiuza, P. O.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gao, F.;Garcia-Sandoval, R.;Gasca-Pineda, J.;Gautam, A. K.;Ghobad-Nejhad, M.;Ghosh, A.;Giachini, A. J.;Gentekaki, E.;Gmoshinskiy, V., I;Goes-Neto, A.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H-P;Grossart, H-P;Gueidan, C.;Gunaseelan, S.;Guo, S. L.;Gutierrez, A. C.;Haelewaters, D.;Halling, R. E.;Hosoya, T.;Hoog, S. D.;Horak, E.;Hou, C. L.;Huang, S. K.;Huang, W. J.;Hurdeal, V. G.;Hustad, V. P.;Inacio, C. A.;Jayalal, R. G. U.;Jeewon, R.;Jeronimo, G. H.;Jin, J.;Jones, E. B. G.;Joshi, Y.;Jurjevic, Z.;Justo, A.;Kakishima, M.;Kaliyaperumal, M.;Kang, G. P.;Kang, G. P.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karpov, S. A.;Kezo, K.;Khan, M. K.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Klawonn, I;Kraisitudomsook, N.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Lachance, M. A.;Lado, C.;Latha, K. P. D.;Lee, H. B.;Leonardi, M.;Lestari, A. S.;Li, Q.;Lima, N. B.;Lin, L.;Liu, S.;Liu, S.;Liu, X. Y.;Longcore, J. E.;Lumbsch, H. T.;Luo, Z. L.;Ma, J.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevakumar, S.;Malysh, J. M.;Manfrino, R. G.;Manimohan, P.;Mao, N.;Marasinghe, D. S.;Mardones, M.;Mardones, M.;Marin-Felix, Y.;Marin-Felix, Y.;Masigol, H.;Mehrabi, M.;Melo, R. F. R.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Miksik, M.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moroz, E. L.;Nagy, G. L.;Najafiniya, M.;Nanayakkara, C. M.;Neves, M. A.;Yong, Nie;Nilsson, R. H.;Nogueira, P. T. S.;Noordeloos, M.;Norphanphoun, C.;Nunez Otano, N.;Zapata, C., V;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Oliveira, J. A.;Oliveira, P. H. F.;Orihara, T.;Oset, M.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pereira, O. L.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Quan, Y.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Soumyadeep, Rajwar;AB, Ralaiveloarisoa;Rama, T.;Rambold, G.;Raza, M.;Ren, G. C.;Rinaldi, A. C.;Rivas-Ferreiro, M.;Robledo, G. L.;Rossi, W.;Rusevska, K.;Ryberg, M.;Salimi, F.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Santos, A. C. D. S.;Santos, L. A. dos;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, A.;Saxena, R. K.;Schoutteten, N.;Schoutteten, N.;Sharma, A.;Shen, H. W.;Shen, Y. M.;Silva-Filho, A. G. S.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sohrabi, M.;de Souza, F. A.;Sri-indrasutdhi, V;Sruthi, O. P.;Stemler, J.;Stemler, J.;Feng, Cai M.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Stoyneva-Gaertner, M. P.;Strassert, J. F. H.;Su, H.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tan, T. H.;Tan, T. H.;Tanaka, K.;Tang, C.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Thambugala, K. M.;Thilanga, D.;Thines, M.;Thines, M.;Tokarev, Y. S.;Tomsovsky, M.;Torruella, G.;Tsurykau, A.;Udayanga, D.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Vadthanarat, S.;Valenzuela, R.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Tang, A. M. C.;Walker, A. K.;Wang, Q. M.;Wang, Y.;Wang, X. Y.;Wang, Z. Y.;Wannathes, N.;Wartchow, F.;Weerakoon, G.;White, J. F.;Wijesundara, D. S. A.;Wisitrassameewong, K.;Wu, H. X.;Xiong, Y. R.;Xu, J. P.;Xu, R.;Xu, R. J.;Yadav, S.;Yakovchenko, L. S.;Yoshioka, R.;Yoshioka, R.;Yu, Z. F.;Zamora, J. C.;Zeng, X. Y.;Zhang, J. F.;Zhang, J. F.;Zhao, H.;Zvyagina, E.;Zvyagina, E.

    关键词:classes; classification; families; genera; orders; phyla

  • Characterization of Radiation-Resistant Yeast Isolated from Radiation-Polluted Areas and Its Potential Application in Bioremediation

    作者:Liu, T.;Liu, X.;Jiang, L.;Liu, T.;Liu, X.;Huang, H.;Zhu, J.;Tang, Q.;Wang, W.;Zhang, Z.;Zhu, L.;Zhang, Z.

    关键词:Cryptococcus; radiation resistance; heavy metal resistance; bioremediation

  • Analysis of mRNA abundance for histone variants, histone- and DNA-modifiers in bovine in vivo and in vitro oocytes and embryos

    作者:Duan, J.;Zhu, L.;Jiang, Z.;Tian, X. C.;Dong, H.;Zheng, X.;Chen, J.;Jiang, Z.

    关键词:

  • Kaempferol inhibited bovine herpesvirus 1 replication and LPS-induced inflammatory response

    作者:Zhu, L.;Wang, P.;Zhu, G.;Zhu, L.;Wang, P.;Zhu, G.;Yuan, W.

    关键词:BoHV-1; inflammation; Kaempferol; cytokine

  • First report of bovine herpesvirus 1 isolation from bull semen samples in China

    作者:Zhu, L.;Yu, Y.;Jiang, X.;Zhu, G.;Zhu, L.;Yu, Y.;Jiang, X.;Zhu, G.;Yuan, W.

    关键词:BoHV-1;virus isolation;VP16;CPE

  • Coverage Optimization Strategy for WSN based on Energy-aware

    作者:Zhu, L.;Fan, C.;Wen, Z.;Wu, H.

    关键词:WSN; coverage optimization; energy-aware; hole repair; sensing radius