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穿心莲NAC基因家族的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐世强 1 ; 李静宇 1 ; 孙铭阳 1 ; 顾艳 1 ; 王继华 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室

关键词： 穿心莲;NAC基因家族;干旱胁迫;MeJA处理;全基因组鉴定;生物信息学;理化性质;进化树;顺式作用元件;染色体位置分布;共线性分析;表达谱分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2024 年 40 卷 036 期

页码： 117-125

收录情况： CSCD

摘要： NAC（包括NAM、ATAF和CUC亚家族）转录因子在植物的生长、发育以及对各种非生物和生物胁迫的响应中发挥重要作用。本研究旨在鉴定和分析穿心莲中的NAC基因家族，通过生物信息学方法鉴定了穿心莲中的NAC基因家族，并对其理化性质、进化关系、顺式作用元件、染色体位置分布、共线性以及表达谱进行了详细分析。共鉴定出91个穿心莲NAC基因，蛋白长度为139～715 aa，不均匀分布在染色体两端；亚细胞定位预测发现绝大多数基因定位在细胞核中；通过和拟南芥NAC蛋白构建进化树，将其分为16个亚家族；物种内共线性分析发现穿心莲NAC中有4组串联复制和36对片段复制基因对；基于亚家族功能保守性，顺式作用元件分析以及干旱胁迫和MeJA处理转录组分析，挖掘了响应穿心莲干旱和穿心莲内酯合成的NAC基因。本研究对穿心莲的NAC基因家族进行了鉴定和分析，预测了干旱和内酯合成相关基因，为后续NAC基因功能研究奠定了基础。

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